120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000397 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000397  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
201 aa  422  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0352  thiopurine S-methyltransferase  40.21 
 
 
209 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.675368 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0462  hypothetical protein  39.61 
 
 
209 aa  149  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0337  thiopurine S-methyltransferase  39.61 
 
 
209 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0653  thiopurine S-methyltransferase  40.84 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.696799  normal  0.788964 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3675  thiopurine S-methyltransferase  39.04 
 
 
201 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0190  thiopurine S-methyltransferase family protein  40.84 
 
 
261 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2403  thiopurine S-methyltransferase family protein  40.84 
 
 
261 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2755  thiopurine S-methyltransferase family protein  40.84 
 
 
256 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.712624  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2323  thiopurine S-methyltransferase family protein  40.84 
 
 
256 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0378  thiopurine S-methyltransferase  40.64 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0557  thiopurine S-methyltransferase family protein  40.31 
 
 
245 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0849  thiopurine S-methyltransferase family protein  40.31 
 
 
267 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0988064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0688  putative thiopurine S-methyltransferase  40.31 
 
 
264 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0672  putative thiopurine S-methyltransferase  40.31 
 
 
267 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4046  hypothetical protein  39.36 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.877488 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0435  thiopurine S-methyltransferase  36.32 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2755  thiopurine S-methyltransferase  38.95 
 
 
208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0701437  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0571  thiopurine S-methyltransferase  38.95 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372489  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2116  thiopurine S-methyltransferase  37.89 
 
 
208 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2728  thiopurine S-methyltransferase  37.89 
 
 
208 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236769  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2779  thiopurine S-methyltransferase  37.37 
 
 
208 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6055  thiopurine S-methyltransferase  36.32 
 
 
210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2646  thiopurine S-methyltransferase  37.37 
 
 
208 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178903 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00890  hypothetical protein  26.94 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.267163  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3410  hypothetical protein  31.88 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.134016 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1383  thiopurine S-methyltransferase  27.85 
 
 
198 aa  72  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875719  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1044  thiopurine S-methyltransferase  27.21 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1799  hypothetical protein  25.65 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.378794  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1421  thiopurine S-methyltransferase  27.61 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4948  thiopurine S-methyltransferase  27.27 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527262  normal  0.560333 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0580  thiopurine S-methyltransferase  29.94 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.947193  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2747  thiopurine S-methyltransferase  23.7 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0541  thiopurine S-methyltransferase  26.6 
 
 
218 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3784  thiopurine S-methyltransferase  26.6 
 
 
218 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2892  thiopurine S-methyltransferase  23.12 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3727  thiopurine S-methyltransferase  26.6 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0124  thiol methyltransferase 1-like  24.87 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0581  thiopurine S-methyltransferase  28.25 
 
 
218 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.904773 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3910  thiopurine S-methyltransferase  26.6 
 
 
218 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05270  conserved hypothetical protein  23.96 
 
 
216 aa  55.8  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2081  thiopurine S-methyltransferase  27.39 
 
 
201 aa  55.8  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.858928  normal  0.891479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3057  thiopurine S-methyltransferase  27.27 
 
 
216 aa  55.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  29.27 
 
 
202 aa  55.5  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1335  thiopurine S-methyltransferase  27.7 
 
 
202 aa  55.1  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.249903 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0582  thiopurine S-methyltransferase  27.12 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6497  Thiopurine S-methyltransferase  28.39 
 
 
228 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0320896  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3449  thiopurine S-methyltransferase  27.68 
 
 
218 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30453  predicted protein  26.34 
 
 
237 aa  53.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
195 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  26.67 
 
 
200 aa  52.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1333  thiopurine S-methyltransferase  26.42 
 
 
230 aa  52.4  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3813  methyltransferase type 12  23.53 
 
 
226 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.332384  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1758  thiopurine S-methyltransferase  25.33 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0947  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0974  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0589694  normal  0.0919169 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1814  thiopurine S-methyltransferase  24.17 
 
 
213 aa  50.1  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0216423  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4557  thiopurine S-methyltransferase  27.44 
 
 
229 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2244  thiopurine S-methyltransferase  21.03 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4927  Methyltransferase type 12  20.9 
 
 
218 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167193  normal  0.017224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2087  Methyltransferase type 11  25.66 
 
 
221 aa  49.3  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.261869 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34805  predicted protein  24.64 
 
 
252 aa  49.3  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0588  thiopurine S-methyltransferase  25.28 
 
 
219 aa  49.3  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00909445  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3096  thiopurine S-methyltransferase family protein  22.87 
 
 
212 aa  48.9  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1777  thiopurine s-methyltransferase  26.89 
 
 
220 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3296  thiopurine S-methyltransferase  26.4 
 
 
218 aa  48.9  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3498  thiopurine S-methyltransferase  24.6 
 
 
219 aa  48.5  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2525  thiopurine S-methyltransferase  23.53 
 
 
219 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186445  normal  0.445106 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  26.61 
 
 
200 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0514  thiopurine S-methyltransferase  26.21 
 
 
221 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3055  thiopurine S-methyltransferase  24.62 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1783  Methyltransferase type 11  25.15 
 
 
258 aa  47.4  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  30.08 
 
 
210 aa  47.4  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  25.53 
 
 
199 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  32.04 
 
 
238 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003701  thiopurine S-methyltransferase  25.29 
 
 
226 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.994639  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  28.57 
 
 
200 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0541  thiopurine S-methyltransferase  24.32 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1524  thiopurine S-methyltransferase  23.53 
 
 
219 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2323  thiopurine S-methyltransferase  27.1 
 
 
218 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  24.43 
 
 
236 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  32.04 
 
 
235 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2549  adenylylsulfate kinase  26.06 
 
 
388 aa  45.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.064569 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3261  thiopurine S-methyltransferase  23.16 
 
 
218 aa  46.2  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154958  hitchhiker  0.00386199 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  28.69 
 
 
192 aa  45.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  23.31 
 
 
222 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  22.56 
 
 
236 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  22.56 
 
 
236 aa  44.7  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  22.56 
 
 
236 aa  44.7  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  22.56 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1607  methyltransferase type 11  24.55 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722742  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1553  methyltransferase type 11  24.55 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920902  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  28.32 
 
 
192 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0288  thiopurine S-methyltransferase  23.19 
 
 
230 aa  44.3  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  22.9 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3438  thiopurine S-methyltransferase  22.03 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  21.05 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  26.85 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27460  thiopurine S-methyltransferase  26.03 
 
 
218 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00890318  normal  0.191816 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>