75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1524 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1524  thiopurine S-methyltransferase  100 
 
 		 219 aa  454  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3096  thiopurine S-methyltransferase family protein  45.83 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3438  thiopurine S-methyltransferase  46.98 
 
 		 213 aa  209  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2726  thiopurine S-methyltransferase  44.7 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02272  thiopurine S-methyltransferase family protein  44.84 
 
 		 217 aa  181  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3985  thiopurine S-methyltransferase  38.5 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.971447 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2244  thiopurine S-methyltransferase  35.48 
 
 		 219 aa  157  8e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2525  thiopurine S-methyltransferase  37.33 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186445  normal  0.445106 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1333  thiopurine S-methyltransferase  38.28 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0288  thiopurine S-methyltransferase  37.91 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0541  thiopurine S-methyltransferase  38.39 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3910  thiopurine S-methyltransferase  37.5 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1777  thiopurine s-methyltransferase  35.53 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3727  thiopurine S-methyltransferase  37.05 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3784  thiopurine S-methyltransferase  36.61 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0581  thiopurine S-methyltransferase  35.27 
 
 		 218 aa  141  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.904773 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3296  thiopurine S-methyltransferase  37.5 
 
 		 218 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3449  thiopurine S-methyltransferase  35.27 
 
 		 218 aa  138  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27460  thiopurine S-methyltransferase  36.49 
 
 		 218 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00890318  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1479  thiopurine S-methyltransferase  35 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.193618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15380  Thiopurine S-methyltransferase  37.5 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417119  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2323  thiopurine S-methyltransferase  36.94 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0580  thiopurine S-methyltransferase  34.8 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.947193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0588  thiopurine S-methyltransferase  35.82 
 
 		 219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00909445  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3617  thiopurine S-methyltransferase  33.77 
 
 		 220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0582  thiopurine S-methyltransferase  36.56 
 
 		 218 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2259  thiopurine S-methyltransferase  36.89 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.498891  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0543  thiopurine S-methyltransferase  36.82 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0425379  hitchhiker  0.00996251 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2747  thiopurine S-methyltransferase  36.53 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1758  thiopurine S-methyltransferase  32.27 
 
 		 211 aa  131  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2892  thiopurine S-methyltransferase  36.53 
 
 		 221 aa  131  9e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0794  thiopurine S-methyltransferase  34.06 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000172804  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3498  thiopurine S-methyltransferase  34.33 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4153  thiopurine S-methyltransferase  35.82 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0453346  normal  0.132491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3845  thiopurine S-methyltransferase  33 
 
 		 216 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0510882  normal  0.488659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1870  thiopurine S-methyltransferase  33 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.629149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0541  thiopurine S-methyltransferase  31.72 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3055  thiopurine S-methyltransferase  33.5 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3261  thiopurine S-methyltransferase  34.8 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154958  hitchhiker  0.00386199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1445  thiopurine S-methyltransferase  34.54 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0413435  normal  0.359474 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4010  thiopurine S-methyltransferase  34.11 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000530597  unclonable  0.000000000128309 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3057  thiopurine S-methyltransferase  34.85 
 
 		 216 aa  111  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1365  thiopurine S-methyltransferase  36.22 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233426 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003701  thiopurine S-methyltransferase  33.18 
 
 		 226 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.994639  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2332  thiopurine S-methyltransferase  31.94 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.742383  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02114  thiopurine S-methyltransferase  33.33 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1814  thiopurine S-methyltransferase  30.63 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0216423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2473  Thiopurine S-methyltransferase  32.84 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.465624 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0849  thiopurine S-methyltransferase  35.96 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000750886  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0515  thiopurine S-methyltransferase  34.42 
 
 		 219 aa  95.1  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2144  Thiopurine S-methyltransferase  29.8 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00106923  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0514  thiopurine S-methyltransferase  35.29 
 
 		 221 aa  88.6  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6497  Thiopurine S-methyltransferase  27.51 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0320896  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05270  conserved hypothetical protein  27.62 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2779  thiopurine S-methyltransferase  25 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6055  thiopurine S-methyltransferase  25.94 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0571  thiopurine S-methyltransferase  25.53 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2755  thiopurine S-methyltransferase  24.61 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0701437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2116  thiopurine S-methyltransferase  25.13 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2728  thiopurine S-methyltransferase  25.13 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236769  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0124  thiol methyltransferase 1-like  21.95 
 
 		 199 aa  48.5  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000397  SAM-dependent methyltransferase  23.53 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4046  hypothetical protein  25.23 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.877488 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2323  thiopurine S-methyltransferase family protein  23.04 
 
 		 256 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2403  thiopurine S-methyltransferase family protein  23.04 
 
 		 261 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2755  thiopurine S-methyltransferase family protein  23.04 
 
 		 256 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.712624  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0190  thiopurine S-methyltransferase family protein  23.04 
 
 		 261 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2646  thiopurine S-methyltransferase  25 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.178903 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0653  thiopurine S-methyltransferase  23.94 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.696799  normal  0.788964 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1044  thiopurine S-methyltransferase  21.79 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0688  putative thiopurine S-methyltransferase  23.04 
 
 		 264 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0849  thiopurine S-methyltransferase family protein  23.04 
 
 		 267 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0988064  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0378  thiopurine S-methyltransferase  25.57 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06094  thiol methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13570)  25.79 
 
 		 283 aa  42.4  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0045541 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0557  thiopurine S-methyltransferase family protein  23.04 
 
 		 245 aa  41.6  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>