83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1870 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1870  thiopurine S-methyltransferase  100 
 
 		 216 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.629149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3845  thiopurine S-methyltransferase  96.76 
 
 		 216 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0510882  normal  0.488659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1445  thiopurine S-methyltransferase  80.09 
 
 		 216 aa  363  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0413435  normal  0.359474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1479  thiopurine S-methyltransferase  77.57 
 
 		 215 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.193618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2525  thiopurine S-methyltransferase  59.91 
 
 		 219 aa  269  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186445  normal  0.445106 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15380  Thiopurine S-methyltransferase  61.75 
 
 		 218 aa  267  8.999999999999999e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417119  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3985  thiopurine S-methyltransferase  61.4 
 
 		 217 aa  265  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.971447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1777  thiopurine s-methyltransferase  52.53 
 
 		 220 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3617  thiopurine S-methyltransferase  50.69 
 
 		 220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27460  thiopurine S-methyltransferase  53.46 
 
 		 218 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00890318  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2323  thiopurine S-methyltransferase  52.07 
 
 		 218 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3498  thiopurine S-methyltransferase  45.62 
 
 		 219 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3261  thiopurine S-methyltransferase  45.62 
 
 		 218 aa  197  7e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154958  hitchhiker  0.00386199 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0588  thiopurine S-methyltransferase  43.32 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00909445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0543  thiopurine S-methyltransferase  45.87 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0425379  hitchhiker  0.00996251 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4153  thiopurine S-methyltransferase  45.25 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0453346  normal  0.132491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0794  thiopurine S-methyltransferase  44.86 
 
 		 222 aa  190  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000172804  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2259  thiopurine S-methyltransferase  42.72 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.498891  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3055  thiopurine S-methyltransferase  43.43 
 
 		 219 aa  184  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3784  thiopurine S-methyltransferase  42.4 
 
 		 218 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0541  thiopurine S-methyltransferase  42.4 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0541  thiopurine S-methyltransferase  42.86 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3727  thiopurine S-methyltransferase  41.94 
 
 		 218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3449  thiopurine S-methyltransferase  42.4 
 
 		 218 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0581  thiopurine S-methyltransferase  42.4 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.904773 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4010  thiopurine S-methyltransferase  41.96 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000530597  unclonable  0.000000000128309 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0580  thiopurine S-methyltransferase  42.4 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.947193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3910  thiopurine S-methyltransferase  41.47 
 
 		 218 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0582  thiopurine S-methyltransferase  43.32 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1758  thiopurine S-methyltransferase  43.68 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3296  thiopurine S-methyltransferase  42.4 
 
 		 218 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003701  thiopurine S-methyltransferase  44.08 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.994639  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2244  thiopurine S-methyltransferase  42.35 
 
 		 219 aa  167  9e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2726  thiopurine S-methyltransferase  49.44 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3096  thiopurine S-methyltransferase family protein  40.41 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02114  thiopurine S-methyltransferase  42.65 
 
 		 216 aa  161  8.000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0849  thiopurine S-methyltransferase  43.78 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000750886  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2332  thiopurine S-methyltransferase  47.43 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.742383  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1814  thiopurine S-methyltransferase  39.17 
 
 		 213 aa  158  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0216423  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0514  thiopurine S-methyltransferase  52.6 
 
 		 221 aa  157  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3438  thiopurine S-methyltransferase  38.1 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0515  thiopurine S-methyltransferase  39.45 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766215 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02272  thiopurine S-methyltransferase family protein  38.14 
 
 		 217 aa  138  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1365  thiopurine S-methyltransferase  37.74 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233426 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2892  thiopurine S-methyltransferase  38.01 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2747  thiopurine S-methyltransferase  38.01 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2473  Thiopurine S-methyltransferase  37.06 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.465624 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0288  thiopurine S-methyltransferase  37.44 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6497  Thiopurine S-methyltransferase  35.08 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0320896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1524  thiopurine S-methyltransferase  33 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3057  thiopurine S-methyltransferase  36.72 
 
 		 216 aa  118  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2144  Thiopurine S-methyltransferase  37.44 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00106923  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1333  thiopurine S-methyltransferase  34.67 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4046  hypothetical protein  28 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.877488 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0653  thiopurine S-methyltransferase  26.44 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.696799  normal  0.788964 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0557  thiopurine S-methyltransferase family protein  26.74 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05270  conserved hypothetical protein  25.28 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0571  thiopurine S-methyltransferase  28.06 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0378  thiopurine S-methyltransferase  26.59 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0435  thiopurine S-methyltransferase  26.44 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00890  hypothetical protein  26.87 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.267163  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0672  putative thiopurine S-methyltransferase  26.16 
 
 		 267 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0688  putative thiopurine S-methyltransferase  26.16 
 
 		 264 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2323  thiopurine S-methyltransferase family protein  28.16 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2403  thiopurine S-methyltransferase family protein  28.16 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2755  thiopurine S-methyltransferase family protein  28.16 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.712624  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0190  thiopurine S-methyltransferase family protein  28.16 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0849  thiopurine S-methyltransferase family protein  26.16 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0988064  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6055  thiopurine S-methyltransferase  29.07 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0337  thiopurine S-methyltransferase  27.84 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0462  hypothetical protein  27.01 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1383  thiopurine S-methyltransferase  27.37 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875719  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0352  thiopurine S-methyltransferase  25.57 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.675368 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1799  hypothetical protein  28.33 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.378794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2081  thiopurine S-methyltransferase  28.49 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.858928  normal  0.891479 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0124  thiol methyltransferase 1-like  26.74 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3675  thiopurine S-methyltransferase  28 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2779  thiopurine S-methyltransferase  27.75 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1335  thiopurine S-methyltransferase  27.01 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.249903 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2755  thiopurine S-methyltransferase  27.33 
 
 		 208 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0701437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1044  thiopurine S-methyltransferase  25.14 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2116  thiopurine S-methyltransferase  27.33 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2728  thiopurine S-methyltransferase  27.33 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>