87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2525 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2525  thiopurine S-methyltransferase  100 
 
 		 219 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186445  normal  0.445106 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15380  Thiopurine S-methyltransferase  66.51 
 
 		 218 aa  297  9e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417119  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3985  thiopurine S-methyltransferase  64.35 
 
 		 217 aa  292  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.971447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3845  thiopurine S-methyltransferase  60.83 
 
 		 216 aa  272  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0510882  normal  0.488659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1870  thiopurine S-methyltransferase  59.91 
 
 		 216 aa  269  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.629149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2323  thiopurine S-methyltransferase  61.29 
 
 		 218 aa  268  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27460  thiopurine S-methyltransferase  58.99 
 
 		 218 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00890318  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1479  thiopurine S-methyltransferase  60.65 
 
 		 215 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.193618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1445  thiopurine S-methyltransferase  58.53 
 
 		 216 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0413435  normal  0.359474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1777  thiopurine s-methyltransferase  50.92 
 
 		 220 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3617  thiopurine S-methyltransferase  48.86 
 
 		 220 aa  227  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3261  thiopurine S-methyltransferase  47.25 
 
 		 218 aa  210  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154958  hitchhiker  0.00386199 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0588  thiopurine S-methyltransferase  46.79 
 
 		 219 aa  207  9e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00909445  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2259  thiopurine S-methyltransferase  46.79 
 
 		 220 aa  204  7e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.498891  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4153  thiopurine S-methyltransferase  45.5 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0453346  normal  0.132491 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3449  thiopurine S-methyltransferase  45.87 
 
 		 218 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0581  thiopurine S-methyltransferase  45.87 
 
 		 218 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.904773 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0541  thiopurine S-methyltransferase  44.5 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3784  thiopurine S-methyltransferase  44.5 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3727  thiopurine S-methyltransferase  44.5 
 
 		 218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3055  thiopurine S-methyltransferase  47.21 
 
 		 219 aa  194  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3296  thiopurine S-methyltransferase  46.33 
 
 		 218 aa  194  7e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3910  thiopurine S-methyltransferase  44.5 
 
 		 218 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0580  thiopurine S-methyltransferase  45.41 
 
 		 218 aa  193  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.947193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3498  thiopurine S-methyltransferase  43.38 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0543  thiopurine S-methyltransferase  44.04 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0425379  hitchhiker  0.00996251 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1758  thiopurine S-methyltransferase  47.64 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4010  thiopurine S-methyltransferase  43.56 
 
 		 226 aa  187  9e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000530597  unclonable  0.000000000128309 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0541  thiopurine S-methyltransferase  42.66 
 
 		 218 aa  185  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0582  thiopurine S-methyltransferase  45.41 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0794  thiopurine S-methyltransferase  44.39 
 
 		 222 aa  179  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000172804  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3438  thiopurine S-methyltransferase  42.86 
 
 		 213 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2332  thiopurine S-methyltransferase  46.04 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.742383  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3096  thiopurine S-methyltransferase family protein  41.33 
 
 		 212 aa  169  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2244  thiopurine S-methyltransferase  39.8 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2726  thiopurine S-methyltransferase  43.15 
 
 		 213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0849  thiopurine S-methyltransferase  45.45 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000750886  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003701  thiopurine S-methyltransferase  40.57 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.994639  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1524  thiopurine S-methyltransferase  37.33 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02114  thiopurine S-methyltransferase  40.09 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1814  thiopurine S-methyltransferase  41.97 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0216423  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02272  thiopurine S-methyltransferase family protein  38.05 
 
 		 217 aa  151  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0514  thiopurine S-methyltransferase  47.06 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2747  thiopurine S-methyltransferase  39.04 
 
 		 221 aa  141  9e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2892  thiopurine S-methyltransferase  38.5 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0515  thiopurine S-methyltransferase  41.99 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1365  thiopurine S-methyltransferase  35.48 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233426 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1333  thiopurine S-methyltransferase  35.24 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0288  thiopurine S-methyltransferase  36.54 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2473  Thiopurine S-methyltransferase  35.9 
 
 		 217 aa  132  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.465624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6497  Thiopurine S-methyltransferase  35.91 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0320896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2144  Thiopurine S-methyltransferase  40.53 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00106923  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3057  thiopurine S-methyltransferase  36.41 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0571  thiopurine S-methyltransferase  32.97 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372489  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05270  conserved hypothetical protein  30 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0435  thiopurine S-methyltransferase  32.6 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2755  thiopurine S-methyltransferase  31.47 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0701437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4046  hypothetical protein  30 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.877488 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6055  thiopurine S-methyltransferase  31.79 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0462  hypothetical protein  29.51 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2728  thiopurine S-methyltransferase  32.12 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236769  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2116  thiopurine S-methyltransferase  32.12 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0378  thiopurine S-methyltransferase  31.46 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2779  thiopurine S-methyltransferase  31.32 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0653  thiopurine S-methyltransferase  29.38 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.696799  normal  0.788964 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0337  thiopurine S-methyltransferase  27.32 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00890  hypothetical protein  25.77 
 
 		 191 aa  61.6  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.267163  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2081  thiopurine S-methyltransferase  28.42 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.858928  normal  0.891479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0352  thiopurine S-methyltransferase  25.68 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.675368 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0557  thiopurine S-methyltransferase family protein  26.74 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1799  hypothetical protein  27.98 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.378794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2403  thiopurine S-methyltransferase family protein  27.47 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0190  thiopurine S-methyltransferase family protein  27.47 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2755  thiopurine S-methyltransferase family protein  26.11 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.712624  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2323  thiopurine S-methyltransferase family protein  26.11 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2646  thiopurine S-methyltransferase  32.02 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.178903 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1383  thiopurine S-methyltransferase  29.21 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875719  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0124  thiol methyltransferase 1-like  24.73 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0672  putative thiopurine S-methyltransferase  27.74 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0849  thiopurine S-methyltransferase family protein  28.47 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0988064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0688  putative thiopurine S-methyltransferase  28.47 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30453  predicted protein  30.06 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3675  thiopurine S-methyltransferase  25.44 
 
 		 201 aa  48.9  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1044  thiopurine S-methyltransferase  25.97 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000397  SAM-dependent methyltransferase  23.53 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1335  thiopurine S-methyltransferase  32.89 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.249903 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06094  thiol methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13570)  30.38 
 
 		 283 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0045541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>