110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0462 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0462  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0337  thiopurine S-methyltransferase  81.82 
 
 		 209 aa  343  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0352  thiopurine S-methyltransferase  80.86 
 
 		 209 aa  340  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.675368 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0435  thiopurine S-methyltransferase  60.98 
 
 		 207 aa  234  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0378  thiopurine S-methyltransferase  56.37 
 
 		 213 aa  211  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3675  thiopurine S-methyltransferase  57.51 
 
 		 201 aa  208  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2755  thiopurine S-methyltransferase  57.71 
 
 		 208 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0701437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4046  hypothetical protein  57.56 
 
 		 207 aa  201  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.877488 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0571  thiopurine S-methyltransferase  58.71 
 
 		 208 aa  201  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2116  thiopurine S-methyltransferase  57.71 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2728  thiopurine S-methyltransferase  57.71 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236769  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0653  thiopurine S-methyltransferase  56.86 
 
 		 207 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.696799  normal  0.788964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6055  thiopurine S-methyltransferase  56.72 
 
 		 210 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0557  thiopurine S-methyltransferase family protein  56 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2779  thiopurine S-methyltransferase  56.72 
 
 		 208 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0190  thiopurine S-methyltransferase family protein  56.35 
 
 		 261 aa  193  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2403  thiopurine S-methyltransferase family protein  56.35 
 
 		 261 aa  193  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2755  thiopurine S-methyltransferase family protein  56.35 
 
 		 256 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.712624  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2323  thiopurine S-methyltransferase family protein  56.35 
 
 		 256 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0849  thiopurine S-methyltransferase family protein  55.5 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0988064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0688  putative thiopurine S-methyltransferase  55.5 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0672  putative thiopurine S-methyltransferase  54.5 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2646  thiopurine S-methyltransferase  56.22 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.178903 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000397  SAM-dependent methyltransferase  39.61 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1799  hypothetical protein  33.53 
 
 		 201 aa  88.6  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.378794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00890  hypothetical protein  30.59 
 
 		 191 aa  85.9  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.267163  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3410  hypothetical protein  33.54 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.134016 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2081  thiopurine S-methyltransferase  31.05 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.858928  normal  0.891479 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05270  conserved hypothetical protein  25.85 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4948  thiopurine S-methyltransferase  31.52 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527262  normal  0.560333 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1335  thiopurine S-methyltransferase  35.09 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.249903 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1383  thiopurine S-methyltransferase  32.72 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875719  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30453  predicted protein  33.16 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1421  thiopurine S-methyltransferase  31.33 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1044  thiopurine S-methyltransferase  31.33 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3784  thiopurine S-methyltransferase  28.26 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3727  thiopurine S-methyltransferase  27.72 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2525  thiopurine S-methyltransferase  29.51 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186445  normal  0.445106 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0580  thiopurine S-methyltransferase  28.8 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.947193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3910  thiopurine S-methyltransferase  28.26 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0541  thiopurine S-methyltransferase  27.17 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1814  thiopurine S-methyltransferase  27.27 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0216423  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2332  thiopurine S-methyltransferase  29.53 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.742383  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0581  thiopurine S-methyltransferase  28.92 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.904773 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3449  thiopurine S-methyltransferase  28.92 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02114  thiopurine S-methyltransferase  27.68 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0794  thiopurine S-methyltransferase  30.27 
 
 		 222 aa  62  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000172804  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0849  thiopurine S-methyltransferase  27.84 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000750886  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15380  Thiopurine S-methyltransferase  28.65 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417119  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0124  thiol methyltransferase 1-like  29.9 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3055  thiopurine S-methyltransferase  22.53 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1365  thiopurine S-methyltransferase  24.46 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233426 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0582  thiopurine S-methyltransferase  29.35 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1445  thiopurine S-methyltransferase  27.01 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0413435  normal  0.359474 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  31.58 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003701  thiopurine S-methyltransferase  25.99 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.994639  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3296  thiopurine S-methyltransferase  28.8 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1758  thiopurine S-methyltransferase  26.17 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  30.68 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3845  thiopurine S-methyltransferase  27.59 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0510882  normal  0.488659 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2259  thiopurine S-methyltransferase  26.7 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.498891  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0588  thiopurine S-methyltransferase  24.46 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00909445  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4153  thiopurine S-methyltransferase  27.51 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0453346  normal  0.132491 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1870  thiopurine S-methyltransferase  27.01 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.629149  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2892  thiopurine S-methyltransferase  24.14 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2747  thiopurine S-methyltransferase  24.14 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0541  thiopurine S-methyltransferase  27.03 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1479  thiopurine S-methyltransferase  25.43 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.193618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3985  thiopurine S-methyltransferase  26.82 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.971447 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3261  thiopurine S-methyltransferase  27.89 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154958  hitchhiker  0.00386199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  35.05 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0515  thiopurine S-methyltransferase  30.65 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766215 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2244  thiopurine S-methyltransferase  24.08 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27460  thiopurine S-methyltransferase  26.74 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00890318  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4557  thiopurine S-methyltransferase  27.56 
 
 		 229 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10570  benzoquinone methyltransferase  33.6 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175539  normal  0.480356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  30.23 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4010  thiopurine S-methyltransferase  21.88 
 
 		 226 aa  48.9  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000530597  unclonable  0.000000000128309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0947  Methyltransferase type 11  23.73 
 
 		 225 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0974  Methyltransferase type 11  23.73 
 
 		 225 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0589694  normal  0.0919169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3498  thiopurine S-methyltransferase  21.2 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2323  thiopurine S-methyltransferase  26.19 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  32.03 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  29.22 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5269  Methyltransferase type 12  31.61 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  32.59 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3617  thiopurine S-methyltransferase  23.21 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02272  thiopurine S-methyltransferase family protein  23.38 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 243 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  40.85 
 
 		 223 aa  45.4  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  27.91 
 
 		 200 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  29.77 
 
 		 196 aa  45.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0543  thiopurine S-methyltransferase  22.46 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0425379  hitchhiker  0.00996251 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4409  methyltransferase type 11  34.18 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  30.66 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  21.43 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  31.54 
 
 		 410 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>