230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4948 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008759  Pnap_4948  thiopurine S-methyltransferase  100 
 
 
206 aa  422  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527262  normal  0.560333 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1421  thiopurine S-methyltransferase  77.34 
 
 
203 aa  325  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3410  hypothetical protein  64.4 
 
 
203 aa  241  7e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.134016 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1383  thiopurine S-methyltransferase  46.67 
 
 
198 aa  174  9e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875719  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1044  thiopurine S-methyltransferase  46.43 
 
 
206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1335  thiopurine S-methyltransferase  41.21 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.249903 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0124  thiol methyltransferase 1-like  36.99 
 
 
199 aa  90.9  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3675  thiopurine S-methyltransferase  29.47 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0337  thiopurine S-methyltransferase  34.34 
 
 
209 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0352  thiopurine S-methyltransferase  34.94 
 
 
209 aa  84.7  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.675368 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0435  thiopurine S-methyltransferase  33.52 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0462  hypothetical protein  31.52 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00890  hypothetical protein  28.07 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.267163  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0378  thiopurine S-methyltransferase  34.94 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05270  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6055  thiopurine S-methyltransferase  32.34 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0557  thiopurine S-methyltransferase family protein  33.93 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1799  hypothetical protein  29.79 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.378794  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4046  hypothetical protein  35.54 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.877488 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2755  thiopurine S-methyltransferase  30.54 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0701437  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0571  thiopurine S-methyltransferase  34.44 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372489  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000397  SAM-dependent methyltransferase  27.97 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0190  thiopurine S-methyltransferase family protein  31.74 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2116  thiopurine S-methyltransferase  30.54 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2728  thiopurine S-methyltransferase  30.54 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236769  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2755  thiopurine S-methyltransferase family protein  31.74 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.712624  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2323  thiopurine S-methyltransferase family protein  31.74 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2403  thiopurine S-methyltransferase family protein  31.74 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0849  thiopurine S-methyltransferase family protein  32.12 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0988064  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2779  thiopurine S-methyltransferase  31.33 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0688  putative thiopurine S-methyltransferase  32.12 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0672  putative thiopurine S-methyltransferase  31.52 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  30.22 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2081  thiopurine S-methyltransferase  28.65 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.858928  normal  0.891479 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0653  thiopurine S-methyltransferase  37.32 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.696799  normal  0.788964 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2646  thiopurine S-methyltransferase  31.52 
 
 
208 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178903 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30453  predicted protein  33.08 
 
 
237 aa  62.8  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  33.09 
 
 
209 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  27.39 
 
 
199 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  29.91 
 
 
213 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  30.43 
 
 
541 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  30.43 
 
 
541 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  30.43 
 
 
541 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  30.43 
 
 
541 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06094  thiol methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13570)  24.65 
 
 
283 aa  59.3  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0045541 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  30.43 
 
 
541 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  22.22 
 
 
236 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  22.22 
 
 
236 aa  58.2  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  22.22 
 
 
236 aa  58.2  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  22.22 
 
 
236 aa  58.2  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  21.48 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  22.14 
 
 
236 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2159  Methyltransferase type 12  24.41 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00432182  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  21.48 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1566  Methyltransferase type 11  24.26 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.131267  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  21.48 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 
277 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  30 
 
 
198 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0186  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 
197 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0197  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 
197 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  20.74 
 
 
236 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2892  thiopurine S-methyltransferase  25.88 
 
 
221 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2747  thiopurine S-methyltransferase  25.88 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 
243 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1445  thiopurine S-methyltransferase  27.75 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0413435  normal  0.359474 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34805  predicted protein  24.67 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00198  methyltransferase  34 
 
 
280 aa  53.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.524751  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  24.67 
 
 
201 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2726  thiopurine S-methyltransferase  26.98 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27460  thiopurine S-methyltransferase  27.87 
 
 
218 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00890318  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  30.36 
 
 
223 aa  52  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  35.34 
 
 
309 aa  52  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4409  methyltransferase type 11  31.1 
 
 
205 aa  51.6  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1365  thiopurine S-methyltransferase  21.43 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2323  thiopurine S-methyltransferase  29.14 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  27.55 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
243 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10570  benzoquinone methyltransferase  30.83 
 
 
241 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175539  normal  0.480356 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  26.15 
 
 
196 aa  49.3  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0132  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltrans ferase  33.33 
 
 
392 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0288  thiopurine S-methyltransferase  24.34 
 
 
230 aa  49.3  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4010  thiopurine S-methyltransferase  23.73 
 
 
226 aa  48.9  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000530597  unclonable  0.000000000128309 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0907  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 
220 aa  48.9  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2244  thiopurine S-methyltransferase  30.99 
 
 
219 aa  48.5  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  27.42 
 
 
211 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  32.69 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  19.26 
 
 
236 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1201  Methyltransferase type 12  28.79 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227994  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  30.89 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3033  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  41.89 
 
 
443 aa  47.8  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0849  thiopurine S-methyltransferase  25.14 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000750886  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  25.74 
 
 
215 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3113  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
273 aa  47  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  28.7 
 
 
208 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3418  Fmu (Sun)  28.57 
 
 
460 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2525  thiopurine S-methyltransferase  26.88 
 
 
219 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186445  normal  0.445106 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003701  thiopurine S-methyltransferase  23.53 
 
 
226 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.994639  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1814  thiopurine S-methyltransferase  22.71 
 
 
213 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0216423  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  32.84 
 
 
190 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4471  methyltransferase type 11  26.47 
 
 
214 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00423193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>