290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0907 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0907  Methyltransferase type 11  100 
 
 
220 aa  454  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5314  Methyltransferase type 11  46.03 
 
 
225 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4557  thiopurine S-methyltransferase  43.78 
 
 
229 aa  166  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3813  methyltransferase type 12  44.81 
 
 
226 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.332384  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0947  Methyltransferase type 11  39.3 
 
 
225 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0974  Methyltransferase type 11  39.3 
 
 
225 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0589694  normal  0.0919169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4927  Methyltransferase type 12  41.29 
 
 
218 aa  144  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167193  normal  0.017224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5269  Methyltransferase type 12  43.22 
 
 
219 aa  142  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2087  Methyltransferase type 11  38.58 
 
 
221 aa  123  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.261869 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2424  methyltransferase type 11  44.44 
 
 
216 aa  122  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2219  Methyltransferase type 11  38.12 
 
 
242 aa  102  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.419213 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.67 
 
 
247 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.2 
 
 
229 aa  63.2  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.4 
 
 
232 aa  62  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.3 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  31.73 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.97 
 
 
232 aa  59.3  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  33.6 
 
 
200 aa  58.2  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  30.71 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.96 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2266  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.48 
 
 
232 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549196  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.54 
 
 
259 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 
243 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.75 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3562  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 
200 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.50395 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0918  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.92 
 
 
232 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0317965 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0914  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.92 
 
 
232 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.497259  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0898  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.48 
 
 
260 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000544337  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.75 
 
 
246 aa  55.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  29.23 
 
 
252 aa  56.2  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2150  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.74 
 
 
236 aa  55.8  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.89 
 
 
239 aa  55.8  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.75 
 
 
246 aa  55.5  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1630  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28 
 
 
232 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4151  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.67 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.4 
 
 
234 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.3 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01393  hypothetical protein  27.56 
 
 
535 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.77 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.71 
 
 
245 aa  54.3  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.08 
 
 
238 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2582  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0956  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2892  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2954  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0191  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004080  hypothetical protein  27.14 
 
 
522 aa  54.7  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0437  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198029  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.46 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3003  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.64 
 
 
232 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0839  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.06 
 
 
238 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.64 
 
 
239 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0997  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28 
 
 
232 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448482  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.43 
 
 
242 aa  52.4  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.46 
 
 
243 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.75356  hitchhiker  0.00870455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.77 
 
 
240 aa  52.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0559  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28 
 
 
232 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1038  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28 
 
 
232 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0944  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 
208 aa  52  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891342 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  29.58 
 
 
247 aa  52.4  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  32.69 
 
 
265 aa  52  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
222 aa  52  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.19 
 
 
237 aa  52  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6413  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.34 
 
 
233 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.37 
 
 
238 aa  52  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  26.24 
 
 
575 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  31.93 
 
 
196 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2807  methyltransferase, putative  31.3 
 
 
267 aa  50.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  34.55 
 
 
232 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0736  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.98 
 
 
232 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421351  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28 
 
 
242 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  26.35 
 
 
211 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3011  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.77 
 
 
232 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  normal  0.0163533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  33.94 
 
 
260 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
332 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.67 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.83 
 
 
234 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.83 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0435  thiopurine S-methyltransferase  29.73 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2162  hypothetical protein  36.08 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0386731 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.96 
 
 
241 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0972  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.77 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00675133  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
244 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  29.66 
 
 
283 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
259 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.4 
 
 
232 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  24.6 
 
 
277 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 
239 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  29.44 
 
 
211 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  30.77 
 
 
267 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.82 
 
 
236 aa  49.3  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  30.77 
 
 
267 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.82 
 
 
236 aa  49.3  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  30.77 
 
 
267 aa  49.7  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.91 
 
 
243 aa  49.7  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28 
 
 
238 aa  49.7  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  35 
 
 
410 aa  49.3  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1779  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>