More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6413 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6413  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  100 
 
 		 233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  65.22 
 
 		 233 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  63.48 
 
 		 233 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2038  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  64.07 
 
 		 233 aa  304  8.000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3977  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  63.04 
 
 		 233 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296594  normal  0.175655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3732  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  62.61 
 
 		 233 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254048  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  63.91 
 
 		 236 aa  296  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1844  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  63.04 
 
 		 251 aa  275  6e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  62.39 
 
 		 243 aa  274  9e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  59.91 
 
 		 234 aa  272  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4812  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  61.04 
 
 		 244 aa  258  7e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.1747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5279  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  61.4 
 
 		 243 aa  257  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3722  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  62.61 
 
 		 233 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  49.77 
 
 		 227 aa  209  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  48.68 
 
 		 222 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  48.68 
 
 		 222 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  48.68 
 
 		 222 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  49.13 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1539  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.82 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000799051 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.58 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1907  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.05 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1536  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.8 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.4 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02431  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.33 
 
 		 233 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4469  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.55 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27151  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.02 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2314  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.09 
 
 		 231 aa  112  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0251558  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4433  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.18 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112508 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4371  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.18 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.53 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.51 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2208  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.95 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.44599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0439  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.52 
 
 		 229 aa  108  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.26 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0965  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.93 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2425  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.87 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0288212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3415  magnesium protoporphyrin O-methyltransferase  30.73 
 
 		 228 aa  105  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.762452  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1601  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.85 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3899  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.46 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2105  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.26 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.52 
 
 		 233 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.40434  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.87 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01881  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.43 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.155533  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01971  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.65 
 
 		 232 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0170  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.43 
 
 		 233 aa  99.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.493478  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1283  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.19 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35500  predicted protein  29 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.886527 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_18872  magnesium-protoporphyrin IX methyltransferase  28.44 
 
 		 258 aa  91.7  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333886  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  50.91 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  44.19 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.3 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  42.86 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  49.09 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  39.74 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0172  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 		 991 aa  55.8  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  42.86 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3562  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.50395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  41.25 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  55.56 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.56 
 
 		 297 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5548  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  49.02 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5195  Methyltransferase type 11  30.12 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  25.66 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  38.16 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  37.76 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  31.18 
 
 		 269 aa  52.4  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  35.16 
 
 		 222 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  55.81 
 
 		 195 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.5 
 
 		 238 aa  52.4  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.95 
 
 		 304 aa  52.4  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  39.77 
 
 		 252 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  30 
 
 		 298 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0907  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  32.76 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  30 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  41.56 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  43.28 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0671  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 312 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  36.11 
 
 		 318 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2672  LigA  50 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  25.52 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  52.94 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.59 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  45.83 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  40.98 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  42.86 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00196  biotin synthesis protein  44.9 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.505545  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.86 
 
 		 298 aa  49.7  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1691  Methyltransferase type 11  35.63 
 
 		 262 aa  49.7  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  43.1 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 232 aa  49.7  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  29.78 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.59 
 
 		 246 aa  49.3  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2530  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 262 aa  48.9  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 257 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.09 
 
 		 236 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  47.92 
 
 		 260 aa  48.9  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1668  hypothetical protein  36.25 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>