More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3807 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  100 
 
 
257 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  98.05 
 
 
257 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  98.44 
 
 
257 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  96.89 
 
 
257 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  87.16 
 
 
260 aa  471  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  87.89 
 
 
262 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  87.89 
 
 
262 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  86.38 
 
 
261 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  87.01 
 
 
257 aa  462  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  74.41 
 
 
254 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  71.65 
 
 
256 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  68.24 
 
 
284 aa  367  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  65.62 
 
 
256 aa  345  4e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  44.31 
 
 
261 aa  241  6e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.31 
 
 
261 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  44.31 
 
 
261 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  44.31 
 
 
261 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  44.31 
 
 
261 aa  241  7.999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  44.31 
 
 
261 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  44.31 
 
 
261 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  44.31 
 
 
261 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  44.31 
 
 
261 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  44.19 
 
 
267 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  44.19 
 
 
267 aa  238  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  44.19 
 
 
267 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  44.19 
 
 
267 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  44.19 
 
 
267 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  42.75 
 
 
261 aa  226  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  42.75 
 
 
261 aa  222  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  43.65 
 
 
278 aa  222  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  41.57 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  42.02 
 
 
261 aa  219  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  41.57 
 
 
261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  41.57 
 
 
261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  41.57 
 
 
261 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  41.37 
 
 
258 aa  211  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  40.24 
 
 
263 aa  210  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  39.84 
 
 
260 aa  209  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  39.44 
 
 
263 aa  206  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  37.36 
 
 
271 aa  202  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  39.44 
 
 
259 aa  199  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  39.84 
 
 
252 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1544  methyltransferase  40.23 
 
 
295 aa  176  3e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  40.23 
 
 
295 aa  175  6e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  39.68 
 
 
249 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  37.4 
 
 
268 aa  169  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  38.89 
 
 
249 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  35.2 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  39.68 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  38.1 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  38.1 
 
 
249 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  34.12 
 
 
259 aa  159  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  39.29 
 
 
249 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
249 aa  159  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  38.49 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  37.3 
 
 
249 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  36.33 
 
 
262 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  38.49 
 
 
249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  35.94 
 
 
267 aa  151  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  35 
 
 
221 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  34.27 
 
 
199 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  26.53 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  33.55 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  29.05 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  26.23 
 
 
252 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.89 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2165  methyltransferase type 12  27.03 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252103  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3474  Methyltransferase type 12  28.05 
 
 
268 aa  63.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  26.79 
 
 
270 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0342  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 
252 aa  62.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  31.82 
 
 
252 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  31.29 
 
 
265 aa  62.4  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  28.39 
 
 
249 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  24.42 
 
 
245 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.77 
 
 
239 aa  60.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
268 aa  60.1  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.95 
 
 
391 aa  59.3  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.83 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.83 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 
252 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  34.13 
 
 
255 aa  56.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.37 
 
 
225 aa  56.2  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  33.33 
 
 
265 aa  55.8  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
267 aa  55.5  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  33.33 
 
 
267 aa  55.5  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0381  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.04 
 
 
261 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111253  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  29.75 
 
 
237 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.37 
 
 
237 aa  55.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2856  methyltransferase type 12  30.82 
 
 
269 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.4 
 
 
277 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.37 
 
 
237 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
267 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.86 
 
 
246 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3238  methyltransferase type 11  29.37 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0679284  normal  0.0358471 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1462  Methyltransferase type 12  32.74 
 
 
434 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.66 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.81 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.08 
 
 
238 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.25 
 
 
240 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.970873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>