More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2208 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2208  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  100 
 
 
233 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.44599  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  78.97 
 
 
233 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  74.03 
 
 
232 aa  377  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  75.44 
 
 
232 aa  379  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  74.67 
 
 
232 aa  375  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2314  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  70.74 
 
 
231 aa  363  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0251558  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  68.4 
 
 
232 aa  356  1.9999999999999998e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1907  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  43.78 
 
 
237 aa  217  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1539  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  44.78 
 
 
237 aa  217  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000799051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1283  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  44.93 
 
 
226 aa  206  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3899  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.07 
 
 
228 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3415  magnesium protoporphyrin O-methyltransferase  33.92 
 
 
228 aa  148  8e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.762452  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4371  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.33 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4433  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.33 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112508 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0439  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.78 
 
 
229 aa  142  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0965  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.63 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01881  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.92 
 
 
232 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.155533  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01971  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.49 
 
 
232 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4469  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.36 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.08 
 
 
233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.40434  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0170  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.63 
 
 
233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.493478  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02431  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.39 
 
 
233 aa  131  9e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1536  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.94 
 
 
233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35500  predicted protein  31.7 
 
 
235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.886527 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.17 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1601  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.97 
 
 
253 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.27 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2105  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.53 
 
 
237 aa  128  9.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.91 
 
 
233 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27151  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.39 
 
 
237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2425  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.34 
 
 
237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0288212  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3722  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.74 
 
 
233 aa  125  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1844  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.72 
 
 
251 aa  125  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.45 
 
 
234 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2038  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.73 
 
 
233 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3977  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.44 
 
 
233 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296594  normal  0.175655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3732  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.44 
 
 
233 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254048  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_18872  magnesium-protoporphyrin IX methyltransferase  28.63 
 
 
258 aa  122  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333886  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.57 
 
 
233 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4812  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.73 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5279  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.27 
 
 
243 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.41 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6413  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.95 
 
 
233 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.84 
 
 
222 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.3 
 
 
222 aa  95.1  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.3 
 
 
222 aa  95.1  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.49 
 
 
227 aa  90.1  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.4 
 
 
229 aa  85.1  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.8 
 
 
246 aa  63.5  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.57 
 
 
246 aa  61.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4538  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.04 
 
 
415 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55402  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.97 
 
 
238 aa  59.3  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.8 
 
 
239 aa  59.3  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
202 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0671  methyltransferase type 11  37.65 
 
 
312 aa  58.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10453  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase ufaA1  24.24 
 
 
427 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  41.25 
 
 
256 aa  55.8  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.67 
 
 
201 aa  55.8  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.77 
 
 
258 aa  55.8  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.33 
 
 
247 aa  55.1  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1047  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.93 
 
 
403 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350309  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.23 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.03 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3431  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.49 
 
 
403 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.03 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 
239 aa  53.5  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  28 
 
 
225 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35 
 
 
238 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  31.19 
 
 
263 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  29.14 
 
 
222 aa  52.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0660  methyltransferase type 11  35.14 
 
 
303 aa  52.8  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3585  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.79 
 
 
428 aa  52.8  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.887039  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5830  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.49 
 
 
405 aa  52.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  31 
 
 
276 aa  52.8  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  27.39 
 
 
415 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  33.03 
 
 
235 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3573  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.29 
 
 
377 aa  52.4  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.716424  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  32.18 
 
 
301 aa  52  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  35.11 
 
 
252 aa  52  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  23.19 
 
 
261 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  23.19 
 
 
261 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  23.19 
 
 
261 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  23.19 
 
 
261 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  23.19 
 
 
261 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  30.33 
 
 
390 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.03 
 
 
232 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  37.7 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  38.55 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  23.19 
 
 
261 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  23.19 
 
 
261 aa  51.2  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  23.19 
 
 
261 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00198  methyltransferase  32.43 
 
 
280 aa  51.2  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.524751  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  30 
 
 
266 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  23.19 
 
 
261 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  36.62 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  33.82 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  24.1 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>