151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2425 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2425  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  100 
 
 
237 aa  491  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0288212  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2105  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  86.86 
 
 
237 aa  426  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27151  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  75.85 
 
 
237 aa  381  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02431  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  72.81 
 
 
233 aa  357  7e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1536  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  72.81 
 
 
233 aa  357  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  73.57 
 
 
237 aa  356  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01881  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  61.04 
 
 
232 aa  309  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.155533  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  61.04 
 
 
233 aa  306  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.40434  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01971  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  60.17 
 
 
232 aa  305  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0170  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  60.61 
 
 
233 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.493478  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4469  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  55.8 
 
 
228 aa  266  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_18872  magnesium-protoporphyrin IX methyltransferase  54.91 
 
 
258 aa  260  1e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333886  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3899  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  56.56 
 
 
228 aa  258  7e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3415  magnesium protoporphyrin O-methyltransferase  54.22 
 
 
228 aa  254  8e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.762452  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0439  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  57.92 
 
 
229 aa  253  1.0000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4433  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  53.39 
 
 
231 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112508 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4371  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  53.39 
 
 
231 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0965  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  56.11 
 
 
229 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35500  predicted protein  53.1 
 
 
235 aa  241  7e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.886527 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1601  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  49.79 
 
 
253 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1907  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.51 
 
 
237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.18 
 
 
232 aa  142  5e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1539  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.77 
 
 
237 aa  141  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000799051 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.22 
 
 
232 aa  132  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2314  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.56 
 
 
231 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0251558  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.11 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.7 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2208  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.34 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.44599  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.86 
 
 
233 aa  122  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1283  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.33 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.03 
 
 
236 aa  111  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2038  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.26 
 
 
233 aa  108  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6413  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.87 
 
 
233 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.64 
 
 
234 aa  105  9e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.65 
 
 
227 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.63 
 
 
233 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.03 
 
 
243 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3722  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.88 
 
 
233 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.63 
 
 
233 aa  98.2  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3977  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.63 
 
 
233 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296594  normal  0.175655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3732  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.29 
 
 
233 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254048  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.04 
 
 
222 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5279  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.33 
 
 
243 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1844  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.43 
 
 
251 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.33 
 
 
222 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.33 
 
 
222 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4812  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.03 
 
 
244 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1747 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.04 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.15 
 
 
247 aa  52.4  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.34 
 
 
232 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.01 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.29 
 
 
244 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.01 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.74 
 
 
234 aa  50.8  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.1 
 
 
253 aa  50.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.81 
 
 
232 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.74 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0671  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
312 aa  49.7  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.29 
 
 
237 aa  48.9  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.24 
 
 
232 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.48 
 
 
232 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1048  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  37.36 
 
 
455 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366869  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.48 
 
 
232 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
232 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
232 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.86 
 
 
245 aa  47  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  35.8 
 
 
261 aa  47  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 
275 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  31.13 
 
 
249 aa  46.2  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14811  SAM-dependent methyltransferase  29.46 
 
 
465 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0686712 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
288 aa  46.2  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.87 
 
 
232 aa  45.8  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.96 
 
 
443 aa  45.8  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
225 aa  45.8  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.94 
 
 
256 aa  45.4  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3354  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.87 
 
 
443 aa  45.4  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0093271  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3147  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36.96 
 
 
450 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0637752  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0428  methyltransferase type 11  50 
 
 
278 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0438  methyltransferase type 11  50 
 
 
278 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0218483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0415  methyltransferase type 11  50 
 
 
278 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.670256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.79 
 
 
442 aa  45.1  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  29.47 
 
 
284 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0134  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.63 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200688  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.36 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00659  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- benzoquinol methylase  28.97 
 
 
250 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.27 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2766  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.87 
 
 
450 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000280871  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3479  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.46 
 
 
413 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.949619  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1252  RNA methyltransferase  35.44 
 
 
440 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113803  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3145  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36.96 
 
 
450 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000412374  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1181  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.97 
 
 
445 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0405802  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.16 
 
 
449 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  37.5 
 
 
294 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.62 
 
 
209 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  41.67 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  32.52 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2978  hypothetical protein  32.95 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1052  Methyltransferase type 12  26.06 
 
 
265 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>