More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0228 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  100 
 
 
232 aa  488  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  82.68 
 
 
232 aa  417  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  80.6 
 
 
232 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  78.02 
 
 
232 aa  398  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2314  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  77.49 
 
 
231 aa  394  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0251558  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  76.62 
 
 
233 aa  386  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2208  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  74.67 
 
 
233 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.44599  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1539  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  48.46 
 
 
237 aa  226  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000799051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1907  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  46.09 
 
 
237 aa  222  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1283  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  45.05 
 
 
226 aa  207  9e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3899  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.63 
 
 
228 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4433  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.3 
 
 
231 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112508 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4371  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.3 
 
 
231 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0965  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.08 
 
 
229 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3415  magnesium protoporphyrin O-methyltransferase  32.44 
 
 
228 aa  143  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.762452  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4469  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.89 
 
 
228 aa  143  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0439  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.5 
 
 
229 aa  139  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1601  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.43 
 
 
253 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_18872  magnesium-protoporphyrin IX methyltransferase  32.14 
 
 
258 aa  132  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333886  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01881  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.97 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.155533  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01971  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.69 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.43 
 
 
233 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.40434  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2038  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.88 
 
 
233 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02431  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.68 
 
 
233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1536  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.16 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2425  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.7 
 
 
237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0288212  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0170  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.79 
 
 
233 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.493478  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2105  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.52 
 
 
237 aa  122  6e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35500  predicted protein  31.08 
 
 
235 aa  121  9e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.886527 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1844  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.16 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27151  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.12 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.57 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3977  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.95 
 
 
233 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296594  normal  0.175655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.57 
 
 
233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.19 
 
 
243 aa  119  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3732  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.78 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254048  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.51 
 
 
233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.07 
 
 
234 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.72 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3722  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.54 
 
 
233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4812  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.34 
 
 
244 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6413  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.53 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5279  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.88 
 
 
243 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.24 
 
 
222 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.51 
 
 
222 aa  91.7  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.51 
 
 
222 aa  91.7  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.09 
 
 
229 aa  90.1  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.18 
 
 
227 aa  87  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  43.75 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40 
 
 
238 aa  67  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.58 
 
 
246 aa  65.1  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.8 
 
 
239 aa  64.3  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.75 
 
 
246 aa  62.8  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  36.04 
 
 
263 aa  62.4  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  40.23 
 
 
301 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.48 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  33.1 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.83 
 
 
252 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  36.78 
 
 
239 aa  59.7  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  30.46 
 
 
278 aa  59.7  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3480  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.55 
 
 
438 aa  58.9  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2071  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.24 
 
 
236 aa  58.9  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000425101  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  41.67 
 
 
247 aa  58.9  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1435  ribosomal L11 methyltransferase  28.48 
 
 
276 aa  58.5  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.61 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.61 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.89 
 
 
234 aa  57.4  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.33 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  50 
 
 
267 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  34.83 
 
 
196 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0677  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 
233 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.29 
 
 
239 aa  56.6  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  31.53 
 
 
266 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  32.26 
 
 
237 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.44 
 
 
250 aa  56.2  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0898  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.91 
 
 
260 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000544337  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0474  hypothetical protein  29.41 
 
 
252 aa  56.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  36.25 
 
 
244 aa  56.2  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
226 aa  55.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  43.9 
 
 
215 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.38 
 
 
239 aa  55.8  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.24 
 
 
296 aa  55.5  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.36 
 
 
201 aa  55.8  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.05 
 
 
253 aa  55.8  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.59 
 
 
244 aa  55.5  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.61 
 
 
232 aa  55.5  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.12 
 
 
236 aa  55.5  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3270  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.65 
 
 
241 aa  55.5  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0514123  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0972  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.43 
 
 
232 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00675133  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
238 aa  55.1  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  30.83 
 
 
261 aa  55.1  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0671  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  42.35 
 
 
234 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4859  hypothetical protein  26.88 
 
 
254 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.069885 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  32 
 
 
263 aa  54.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  32.41 
 
 
575 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.82 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>