More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2201 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  100 
 
 		 261 aa  534  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  81.68 
 
 		 278 aa  458  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  76.63 
 
 		 261 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  76.25 
 
 		 261 aa  413  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  70.5 
 
 		 261 aa  387  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  68.58 
 
 		 261 aa  378  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  68.58 
 
 		 261 aa  378  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  68.2 
 
 		 261 aa  378  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  64.73 
 
 		 267 aa  355  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  63.6 
 
 		 261 aa  354  8.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  63.6 
 
 		 261 aa  353  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  63.6 
 
 		 261 aa  353  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  63.6 
 
 		 261 aa  353  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  63.6 
 
 		 261 aa  353  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  64.34 
 
 		 267 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  63.6 
 
 		 261 aa  353  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  64.34 
 
 		 267 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  64.34 
 
 		 267 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  64.34 
 
 		 267 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  63.6 
 
 		 261 aa  353  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  63.6 
 
 		 261 aa  353  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  63.6 
 
 		 261 aa  353  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  62.75 
 
 		 258 aa  342  5e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  47.55 
 
 		 271 aa  268  8e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  50 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  48.44 
 
 		 263 aa  264  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  47.49 
 
 		 259 aa  258  5.0000000000000005e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  47.66 
 
 		 263 aa  258  9e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  46.03 
 
 		 254 aa  228  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  44.53 
 
 		 256 aa  228  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  45.02 
 
 		 262 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  45.02 
 
 		 262 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  43.82 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  42.58 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  42.02 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  42.02 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  41.63 
 
 		 257 aa  218  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  41.63 
 
 		 257 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  42.86 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  41.8 
 
 		 284 aa  209  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  40.31 
 
 		 259 aa  186  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  39.13 
 
 		 247 aa  178  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  40.75 
 
 		 262 aa  178  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  41.43 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  41.37 
 
 		 249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  41.43 
 
 		 249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  40.64 
 
 		 249 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  41.83 
 
 		 252 aa  172  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  42.53 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  40.16 
 
 		 249 aa  165  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  41.37 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  40.96 
 
 		 249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  40.96 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  36.22 
 
 		 252 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  35.61 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  39.44 
 
 		 249 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1544  methyltransferase  35.11 
 
 		 295 aa  159  4e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  37.67 
 
 		 221 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  37.5 
 
 		 199 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  30.5 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  29.96 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  30.71 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0881  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  29.91 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.57 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  29.41 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  28.26 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2165  methyltransferase type 12  31.22 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252103  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1095  putative methyltransferase  29.96 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4926  Methyltransferase type 11  27 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.71 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.59 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3238  methyltransferase type 11  35.67 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0679284  normal  0.0358471 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.83 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.65 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2150  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.26 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.22 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2314  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.57 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0251558  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  36.51 
 
 		 269 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.56 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.88 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.51 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1742  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.3 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581641 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.19 
 
 		 262 aa  52.8  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 265 aa  52.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.19 
 
 		 253 aa  52.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  28.12 
 
 		 780 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 390 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.23 
 
 		 402 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.83 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  27.93 
 
 		 226 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>