More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3722 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3722  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  100 
 
 
233 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1844  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  78.45 
 
 
251 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  77.83 
 
 
243 aa  348  3e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4812  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  77.39 
 
 
244 aa  329  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5279  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  76.52 
 
 
243 aa  324  7e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  66.81 
 
 
236 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2038  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  65.52 
 
 
233 aa  289  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  64.04 
 
 
233 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3732  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  63.6 
 
 
233 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254048  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3977  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  63.6 
 
 
233 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296594  normal  0.175655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  60.78 
 
 
233 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  59.83 
 
 
234 aa  266  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6413  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  62.66 
 
 
233 aa  265  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  51.77 
 
 
227 aa  219  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  51.07 
 
 
229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  50.67 
 
 
222 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  50 
 
 
222 aa  205  6e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  50 
 
 
222 aa  205  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2208  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.74 
 
 
233 aa  135  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.44599  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.97 
 
 
233 aa  134  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.51 
 
 
232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.87 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1539  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  38.96 
 
 
237 aa  125  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000799051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1907  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.44 
 
 
237 aa  125  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2314  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.7 
 
 
231 aa  125  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0251558  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.45 
 
 
232 aa  124  9e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.54 
 
 
232 aa  123  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0965  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.53 
 
 
229 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1536  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.75 
 
 
233 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0439  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.55 
 
 
229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02431  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.17 
 
 
233 aa  114  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4433  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.57 
 
 
231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112508 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4371  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.57 
 
 
231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4469  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.51 
 
 
228 aa  113  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35500  predicted protein  30.87 
 
 
235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.886527 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3415  magnesium protoporphyrin O-methyltransferase  29.55 
 
 
228 aa  111  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.762452  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3899  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.6 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2425  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.88 
 
 
237 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0288212  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27151  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.76 
 
 
237 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01971  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.75 
 
 
232 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2105  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.3 
 
 
237 aa  102  6e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01881  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.08 
 
 
232 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.155533  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1283  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.36 
 
 
226 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_18872  magnesium-protoporphyrin IX methyltransferase  30.04 
 
 
258 aa  99.8  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333886  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1601  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.97 
 
 
253 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.67 
 
 
233 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.40434  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0170  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.67 
 
 
233 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.493478  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.2 
 
 
237 aa  92.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.89 
 
 
239 aa  67  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1691  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 
262 aa  63.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2530  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 
262 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2236  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.94 
 
 
253 aa  61.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0596269  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.84 
 
 
246 aa  61.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.84 
 
 
246 aa  61.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1309  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.63 
 
 
423 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1088  Methyltransferase type 11  43.24 
 
 
251 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  42.35 
 
 
251 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.78 
 
 
256 aa  56.2  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2157  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  40.66 
 
 
434 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016063  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00940  hexaprenyldihydroxybenzoate methyltransferase, putative  33.87 
 
 
344 aa  55.5  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  34.85 
 
 
237 aa  55.8  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2116  methyltransferase type 11  35 
 
 
251 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.518004  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.05 
 
 
244 aa  55.5  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  39.53 
 
 
414 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.29 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  49.18 
 
 
243 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  35.19 
 
 
275 aa  53.9  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  43.27 
 
 
253 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2417  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  42.39 
 
 
414 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.95 
 
 
232 aa  53.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
244 aa  53.5  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  35.76 
 
 
382 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
222 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1872  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.36 
 
 
248 aa  52.4  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466783  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1804  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  39.73 
 
 
422 aa  52.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.399037  hitchhiker  0.0000000665268 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.82 
 
 
238 aa  52.4  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2506  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.55 
 
 
248 aa  52.8  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117869  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 
232 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1803  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.36 
 
 
248 aa  52.4  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0795517  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  34.55 
 
 
386 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.69 
 
 
247 aa  52.4  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0924  Methyltransferase type 11  43.27 
 
 
253 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.132405  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.54 
 
 
243 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  39.24 
 
 
252 aa  52  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
274 aa  52  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.98 
 
 
236 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  32.4 
 
 
218 aa  52  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.12 
 
 
241 aa  52  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.49 
 
 
232 aa  52.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 
232 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  45.9 
 
 
246 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  45.9 
 
 
246 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  45.68 
 
 
253 aa  52  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  38.64 
 
 
382 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  38.89 
 
 
235 aa  52  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3665  Methyltransferase type 11  49.21 
 
 
223 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.98 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2202  hypothetical protein  33.63 
 
 
629 aa  51.2  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.06 
 
 
229 aa  51.6  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  30.08 
 
 
276 aa  51.2  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>