More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1088 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1088  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 251 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2116  methyltransferase type 11  90.36 
 
 		 251 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.518004  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1261  Methyltransferase type 12  70.9 
 
 		 254 aa  368  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0501  methyltransferase type 12  70.9 
 
 		 254 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0241  methyltransferase type 11  71.66 
 
 		 262 aa  365  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0187  Methyltransferase type 11  71.66 
 
 		 262 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.408893  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1312  methyltransferase type 11  70.78 
 
 		 257 aa  358  6e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2697  methyltransferase type 12  66.67 
 
 		 248 aa  340  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5586  Methyltransferase type 11  65.32 
 
 		 253 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  hitchhiker  0.00869296 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  66.27 
 
 		 253 aa  324  7e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0924  Methyltransferase type 11  66.27 
 
 		 253 aa  323  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.132405  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3894  methyltransferase type 11  64.44 
 
 		 257 aa  322  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3222  methyltransferase type 12  62.55 
 
 		 255 aa  315  4e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0876  methyltransferase type 11  64.8 
 
 		 253 aa  314  8e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3267  methyltransferase type 11  54.82 
 
 		 305 aa  265  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1691  Methyltransferase type 11  52.36 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2530  Methyltransferase type 11  51.93 
 
 		 262 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109917 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0040  hypothetical protein  32.78 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3708  hypothetical protein  32.7 
 
 		 241 aa  89  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0409  hypothetical protein  28.84 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1428  methyltransferase type 12  31.95 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678135  hitchhiker  0.000594475 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.13 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0811  hypothetical protein  28.76 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956918  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.65 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.65 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4744  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  41.67 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.752989  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1058  methyltransferase, putative  26.28 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0814  methyltransferase, putative  26.28 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.638021  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  44.32 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0566  methyltransferase, putative  25 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8763  hypothetical protein  28.39 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.613502  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4745  hypothetical protein  29.8 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.211632  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2906  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.61 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1345  methyltransferase putative  26.53 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2763  putative methyltransferase  34.78 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.516525  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54270  hypothetical protein  30.5 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0995  methyltransferase, putative  25 
 
 		 291 aa  62  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.44 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4213  methyltransferase, putative  28.44 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.987743  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3947  methyltransferase, putative  28.44 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0134  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  41.67 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200688  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0895  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0858242  normal  0.196443 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  42.86 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4583  methyltransferase, putative  28.12 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1676  hypothetical protein  27.84 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1481  putative methyltransferase  27.03 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.036883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1890  methyltransferase, putative  37.37 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000006524  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.61 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  48.84 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0897  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  47.67 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2436  methyltransferase, putative  35.04 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2426  putative methyltransferase  36.36 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487881  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2037  methyltransferase  36.36 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0212649  hitchhiker  0.0000106333 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1895  putative methyltransferase  35.04 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.175832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2083  putative methyltransferase  35.04 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.018552  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2062  hypothetical protein  24.31 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.100668  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1950  putative methyltransferase  35.04 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2369  putative methyltransferase  37 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0122535  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0959  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  47.67 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.0282742 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2310  putative methyltransferase  36.36 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0805655  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1077  methyltransferase  27.03 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2035  putative methyltransferase  36.36 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0121  hypothetical protein  25.17 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1440  methyltransferase, putative  28.12 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4281  putative methyltransferase  28.57 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1852  methyltransferase, putative  34 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.670085 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2187  putative methyltransferase  38.46 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000631484  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0922  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  47.62 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512088  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1932  putative methyltransferase  36.36 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2790  methyltransferase, putative  38.24 
 
 		 324 aa  57  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.383321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  30.53 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0298  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.04 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02157  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase domain  33.33 
 
 		 332 aa  57  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0675721  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1075  hypothetical protein  31.46 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.148018  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2111  putative methyltransferase  39.42 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276742  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2412  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.07 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114708  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2503  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.07 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2516  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.07 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158942  normal  0.172126 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0848  Generic methyltransferase  24.62 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2461  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.07 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  normal  0.0528077 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2620  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.07 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0890164  normal  0.121795 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1769  methyltransferase  38.2 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849085  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2102  putative methyltransferase  38.2 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2164  putative methyltransferase  38.2 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.96989  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1846  methyltransferase, putative  30.07 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.528406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.93 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2082  putative methyltransferase  37.08 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0434288  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01842  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.2 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2607  putative methyltransferase  38.2 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.912253  normal  0.116938 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1761  methyltransferase  38.2 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2060  putative methyltransferase  38.2 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.710945 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1315  putative methyltransferase  38.2 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0108  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  38.1 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1965  putative methyltransferase  38.2 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01830  hypothetical protein  38.2 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2120  putative methyltransferase  38.2 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000230478 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1217  putative methyltransferase  38.2 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>