More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2530 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2530  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 262 aa  544  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109917 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1691  Methyltransferase type 11  96.56 
 
 		 262 aa  531  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0876  methyltransferase type 11  53.81 
 
 		 253 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0501  methyltransferase type 12  54.26 
 
 		 254 aa  237  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2697  methyltransferase type 12  54.02 
 
 		 248 aa  236  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5586  Methyltransferase type 11  51.5 
 
 		 253 aa  234  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  hitchhiker  0.00869296 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3894  methyltransferase type 11  53.95 
 
 		 257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  52.19 
 
 		 253 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1088  Methyltransferase type 11  51.93 
 
 		 251 aa  231  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2116  methyltransferase type 11  51.5 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.518004  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0924  Methyltransferase type 11  51.75 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.132405  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3267  methyltransferase type 11  51.77 
 
 		 305 aa  229  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1261  Methyltransferase type 12  52.91 
 
 		 254 aa  226  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1312  methyltransferase type 11  51.56 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3222  methyltransferase type 12  49.78 
 
 		 255 aa  221  8e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0187  Methyltransferase type 11  51.56 
 
 		 262 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.408893  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0241  methyltransferase type 11  51.11 
 
 		 262 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1428  methyltransferase type 12  35.15 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678135  hitchhiker  0.000594475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3708  hypothetical protein  32.74 
 
 		 241 aa  89  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0040  hypothetical protein  28.02 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0409  hypothetical protein  29.13 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.04 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.27 
 
 		 243 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2038  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  38.18 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1844  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.11 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  37.61 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.4 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  38.82 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.55 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.63 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.64 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.63 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2906  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.19 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2763  putative methyltransferase  28.65 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.516525  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001055  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  35.79 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.829142  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1077  methyltransferase  28.73 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  45.12 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  38.33 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.26 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.26 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.03 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  30.46 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3041  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.58 
 
 		 417 aa  55.5  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.178354 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  32.24 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3977  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  38.82 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296594  normal  0.175655 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.73 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4744  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.47 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.752989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1440  methyltransferase, putative  28.18 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2111  putative methyltransferase  26.77 
 
 		 322 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276742  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1872  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.23 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466783  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02157  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase domain  24.87 
 
 		 332 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0675721  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1803  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.23 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0795517  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4745  hypothetical protein  29.12 
 
 		 322 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.211632  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.03 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.82 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  32.87 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4281  putative methyltransferase  27.62 
 
 		 318 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.23 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  40 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3732  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.65 
 
 		 233 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254048  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.47 
 
 		 233 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54270  hypothetical protein  27.62 
 
 		 322 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4367  methyltransferase  27.62 
 
 		 318 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11549  hypothetical protein  29.17 
 
 		 298 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  40.24 
 
 		 247 aa  53.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  42.35 
 
 		 244 aa  53.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.82 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.94 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  26.95 
 
 		 225 aa  53.1  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2369  putative methyltransferase  30 
 
 		 330 aa  52.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0122535  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  33.33 
 
 		 395 aa  52.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4213  methyltransferase, putative  27.47 
 
 		 319 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.987743  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13850  methyltransferase  28.73 
 
 		 319 aa  52.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.76 
 
 		 237 aa  52.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.05 
 
 		 260 aa  52.4  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.76 
 
 		 237 aa  52.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3947  methyltransferase, putative  27.47 
 
 		 319 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.95 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2037  methyltransferase  30.23 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0212649  hitchhiker  0.0000106333 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2310  putative methyltransferase  30.23 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0805655  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4583  methyltransferase, putative  28.57 
 
 		 318 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.85 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2426  putative methyltransferase  30.23 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487881  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1932  putative methyltransferase  31.82 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2035  putative methyltransferase  30.23 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.85 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1481  putative methyltransferase  30 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.036883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8763  hypothetical protein  28.89 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.613502  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1113  bifunctional 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase and 2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  30.63 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.53 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0811  hypothetical protein  30.36 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956918  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.55 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.78 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.86 
 
 		 232 aa  50.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.33 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0298  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.41 
 
 		 254 aa  50.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2143  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.136766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1033  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00915374  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3965  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.6 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>