More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3538 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  100 
 
 
227 aa  464  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  65.5 
 
 
229 aa  298  5e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  65.93 
 
 
222 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  65.93 
 
 
222 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  65.93 
 
 
222 aa  285  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  52.63 
 
 
234 aa  229  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1844  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  52.68 
 
 
251 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  53.85 
 
 
243 aa  226  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  51.56 
 
 
236 aa  221  9e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5279  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  54.75 
 
 
243 aa  218  7e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4812  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  54.3 
 
 
244 aa  217  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1747 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2038  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  49.34 
 
 
233 aa  216  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  50.67 
 
 
233 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6413  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  49.77 
 
 
233 aa  209  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3732  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  50.22 
 
 
233 aa  207  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254048  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  50.23 
 
 
233 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3722  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  51.77 
 
 
233 aa  204  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3977  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  49.33 
 
 
233 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296594  normal  0.175655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1539  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.65 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000799051 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0439  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.74 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2425  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.65 
 
 
237 aa  104  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0288212  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3415  magnesium protoporphyrin O-methyltransferase  30.09 
 
 
228 aa  102  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.762452  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3899  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.65 
 
 
228 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4469  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.36 
 
 
228 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1907  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.76 
 
 
237 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.33 
 
 
232 aa  98.2  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.31 
 
 
232 aa  96.3  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27151  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.8 
 
 
237 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0965  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.77 
 
 
229 aa  94.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2105  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.6 
 
 
237 aa  94.7  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4371  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.11 
 
 
231 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4433  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.11 
 
 
231 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112508 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1536  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.13 
 
 
233 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02431  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.58 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35500  predicted protein  29.73 
 
 
235 aa  89.7  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.886527 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2208  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.49 
 
 
233 aa  90.1  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.44599  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.83 
 
 
237 aa  89.4  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2314  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.77 
 
 
231 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0251558  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.04 
 
 
232 aa  87.4  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.18 
 
 
232 aa  87  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01881  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  24.55 
 
 
232 aa  85.5  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.155533  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1601  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.82 
 
 
253 aa  85.1  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_18872  magnesium-protoporphyrin IX methyltransferase  27.6 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333886  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  25 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.40434  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01971  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  25.33 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.96 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0170  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  25.5 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.493478  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1283  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.27 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.43 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  26.88 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  37.01 
 
 
241 aa  63.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  40 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  26.88 
 
 
235 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  39.6 
 
 
260 aa  62  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.08 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.23 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.23 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  33.33 
 
 
275 aa  60.5  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  36.73 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  30.77 
 
 
235 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
250 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  36.36 
 
 
312 aa  59.3  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  34.96 
 
 
239 aa  58.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  38.27 
 
 
258 aa  58.2  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  39.53 
 
 
247 aa  58.2  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.85 
 
 
239 aa  58.2  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  28.38 
 
 
220 aa  58.2  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  30.77 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 
262 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  36.36 
 
 
268 aa  56.6  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
257 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2236  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.68 
 
 
253 aa  57  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0596269  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  56.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  30.54 
 
 
201 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  38.37 
 
 
252 aa  56.2  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  32.63 
 
 
265 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  40.45 
 
 
251 aa  55.8  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  40.38 
 
 
244 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.68 
 
 
229 aa  55.1  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  32 
 
 
319 aa  55.5  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  36.14 
 
 
252 aa  55.1  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
266 aa  55.1  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4890  methyltransferase type 12  32.84 
 
 
201 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.62 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
218 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  38.75 
 
 
244 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.39 
 
 
232 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.65 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3665  Methyltransferase type 11  28.9 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  42.25 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.93 
 
 
243 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.43 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.04 
 
 
243 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.05 
 
 
217 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.62 
 
 
241 aa  53.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.81 
 
 
238 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2672  LigA  47.62 
 
 
200 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
255 aa  52.8  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>