More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2038 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2038  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  100 
 
 
233 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  69.83 
 
 
236 aa  330  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6413  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  64.07 
 
 
233 aa  304  8.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  66.96 
 
 
243 aa  300  9e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  62.28 
 
 
233 aa  294  8e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  61.64 
 
 
233 aa  294  8e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3732  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  60.78 
 
 
233 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254048  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3977  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  60.34 
 
 
233 aa  286  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296594  normal  0.175655 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1844  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  62.66 
 
 
251 aa  286  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5279  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  67.11 
 
 
243 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4812  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  66.09 
 
 
244 aa  284  7e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1747 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  60.94 
 
 
234 aa  281  6.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3722  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  65.52 
 
 
233 aa  269  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  49.34 
 
 
227 aa  216  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  49.12 
 
 
222 aa  208  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  49.12 
 
 
222 aa  208  7e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  48.9 
 
 
222 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  47.58 
 
 
229 aa  198  7e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1539  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.55 
 
 
237 aa  138  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000799051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1907  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.91 
 
 
237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.88 
 
 
232 aa  128  8.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.05 
 
 
232 aa  126  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2208  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.73 
 
 
233 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.44599  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4469  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.49 
 
 
228 aa  121  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.14 
 
 
232 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2314  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.51 
 
 
231 aa  119  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0251558  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.82 
 
 
232 aa  116  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3899  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.31 
 
 
228 aa  115  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4371  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.62 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4433  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.62 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0965  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.07 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3415  magnesium protoporphyrin O-methyltransferase  29.83 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.762452  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0439  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.04 
 
 
229 aa  113  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.31 
 
 
233 aa  111  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1601  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.44 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2425  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.26 
 
 
237 aa  108  5e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0288212  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01881  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.59 
 
 
232 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.155533  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.49 
 
 
233 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.40434  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35500  predicted protein  27.83 
 
 
235 aa  105  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.886527 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1536  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.94 
 
 
233 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02431  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.32 
 
 
233 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2105  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.82 
 
 
237 aa  102  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01971  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.16 
 
 
232 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0170  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.83 
 
 
233 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.493478  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27151  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.82 
 
 
237 aa  101  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.82 
 
 
237 aa  98.2  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1283  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.44 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_18872  magnesium-protoporphyrin IX methyltransferase  26.18 
 
 
258 aa  92.4  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333886  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2530  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109917 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.04 
 
 
239 aa  60.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1691  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 
262 aa  59.7  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  38.55 
 
 
275 aa  58.9  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  34.11 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
250 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  46.88 
 
 
266 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.88 
 
 
246 aa  56.2  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.45 
 
 
249 aa  56.2  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  41.38 
 
 
251 aa  55.8  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.88 
 
 
246 aa  55.8  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2490  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 
296 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.94 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.34 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  43.55 
 
 
244 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00940  hexaprenyldihydroxybenzoate methyltransferase, putative  33.05 
 
 
344 aa  54.3  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1460  methyltransferase type 11  34.69 
 
 
295 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
232 aa  53.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.13 
 
 
236 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.06 
 
 
247 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  24.49 
 
 
253 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.85 
 
 
238 aa  53.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  40.22 
 
 
200 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2402  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 
296 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
195 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40 
 
 
236 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3562  Methyltransferase type 11  38.16 
 
 
200 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.50395 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.28 
 
 
253 aa  52.4  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40 
 
 
238 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1925  putative methyltransferase  53.06 
 
 
196 aa  52.4  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  41.24 
 
 
240 aa  52.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.17 
 
 
239 aa  52  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  38.89 
 
 
235 aa  52  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.22 
 
 
244 aa  51.6  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0172  glycosyl transferase family protein  34.34 
 
 
991 aa  51.6  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  34.23 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  42.86 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  32.41 
 
 
274 aa  51.2  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  46.15 
 
 
312 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  37.78 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1630  methyltransferase  54.55 
 
 
198 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.798264  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  38.82 
 
 
225 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
283 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  37.97 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0284  hypothetical protein  39.24 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129296  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  37.8 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  46.88 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  37.21 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1113  bifunctional 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase and 2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  30.09 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>