More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3562 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3562  Methyltransferase type 11  100 
 
 
200 aa  394  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.50395 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  42.13 
 
 
198 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3997  Methyltransferase type 11  38.54 
 
 
204 aa  121  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3396  Methyltransferase type 11  41.12 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3294  Methyltransferase type 11  40.5 
 
 
198 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.216078  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  32.16 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5269  Methyltransferase type 12  42.31 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  40.95 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2087  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.261869 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3113  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 
273 aa  67  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  34.5 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  32.74 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4471  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00423193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  32.26 
 
 
200 aa  62  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10570  benzoquinone methyltransferase  33.96 
 
 
241 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175539  normal  0.480356 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  35.07 
 
 
196 aa  61.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  39.05 
 
 
243 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 
199 aa  59.3  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  39.52 
 
 
223 aa  58.5  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.43 
 
 
241 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0974  Methyltransferase type 11  36 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0589694  normal  0.0919169 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0907  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
220 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0947  Methyltransferase type 11  36 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  33.81 
 
 
195 aa  57  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6413  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.55 
 
 
233 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  43.66 
 
 
256 aa  55.5  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  47.76 
 
 
222 aa  55.1  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0186  Methyltransferase type 11  30.27 
 
 
197 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  34.78 
 
 
211 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4557  thiopurine S-methyltransferase  27.86 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3813  methyltransferase type 12  32.69 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.332384  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  30.28 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  40 
 
 
410 aa  53.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.27 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  32.08 
 
 
266 aa  53.9  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0197  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5314  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 
225 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.27 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2424  methyltransferase type 11  35.64 
 
 
216 aa  52.8  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1583  methyltransferase type 11  30.89 
 
 
197 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.634707  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  35.24 
 
 
238 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1254  methyltransferase type 12  36.7 
 
 
226 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.452774  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  40 
 
 
198 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  44.93 
 
 
252 aa  52.8  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2038  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  38.16 
 
 
233 aa  52.8  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
241 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  43.28 
 
 
227 aa  52.4  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
241 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  24.14 
 
 
232 aa  52  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4927  Methyltransferase type 12  30.3 
 
 
218 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167193  normal  0.017224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1553  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
210 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920902  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1607  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
210 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722742  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.33 
 
 
236 aa  51.2  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2807  methyltransferase, putative  32.03 
 
 
267 aa  50.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 
249 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  34.07 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2159  Methyltransferase type 12  29.75 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00432182  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  33.94 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5245  methyltransferase type 12  34.71 
 
 
227 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.654942  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.04 
 
 
239 aa  50.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4877  methyltransferase type 12  34.71 
 
 
227 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  36.28 
 
 
233 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  35.29 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4966  methyltransferase type 12  34.71 
 
 
227 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  35.44 
 
 
216 aa  49.3  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4409  methyltransferase type 11  36.11 
 
 
205 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 
216 aa  49.3  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2138  Methyltransferase type 11  49.15 
 
 
260 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1907  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.62 
 
 
237 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.79 
 
 
246 aa  49.7  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 
258 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2169  hypothetical protein  37.14 
 
 
223 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  42.19 
 
 
229 aa  49.3  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  34.07 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2344  Methyltransferase type 12  32.08 
 
 
205 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.499373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  32.28 
 
 
215 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  33.8 
 
 
196 aa  48.9  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  44.78 
 
 
199 aa  48.9  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  35.11 
 
 
195 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.79 
 
 
246 aa  48.9  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12690  hypothetical protein  29.95 
 
 
250 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.09325e-49  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  34.58 
 
 
244 aa  48.9  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0124  thiol methyltransferase 1-like  34.26 
 
 
199 aa  48.9  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  25.6 
 
 
277 aa  48.9  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  36.89 
 
 
218 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  31.48 
 
 
266 aa  48.5  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1780  methyltransferase type 11  29.75 
 
 
198 aa  48.5  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0020102  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2089  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
315 aa  48.5  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
198 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  24.22 
 
 
246 aa  48.1  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1324  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
224 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  47.06 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  30 
 
 
269 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3056  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
223 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000799279  normal  0.774854 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  50 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
270 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1309  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
231 aa  47.4  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.0297047 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
270 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  31.78 
 
 
247 aa  47.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>