More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2138 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2138  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 260 aa  509  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  50.21 
 
 		 232 aa  208  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.060018  normal  0.471088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  50.2 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  48.61 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5594  Methyltransferase type 11  49.4 
 
 		 249 aa  191  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709179  normal  0.912769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  41.04 
 
 		 246 aa  158  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2128  methyltransferase type 11  39.69 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.26918 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02460  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.39 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.712689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  35.44 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.78 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  36.02 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  35.06 
 
 		 253 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  34.47 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3818  methyltransferase type 12  36.21 
 
 		 250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4660  methyltransferase type 12  36.21 
 
 		 250 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3703  methyltransferase type 12  36.21 
 
 		 250 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.919771  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0586  Methyltransferase type 12  34.91 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2057  Methyltransferase type 12  38.59 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21030  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.36 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 220 aa  68.6  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  25 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3485  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2108  hypothetical protein  39.67 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7150  methyltransferase  37.39 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  25.79 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3137  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  25.85 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  31.78 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1113  bifunctional 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase and 2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  30.83 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  26.21 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.17 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  29.91 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00359705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  25.52 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  25.17 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  25.52 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.07 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.69 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  25.17 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  32.58 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12360  methyltransferase family protein  38.84 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661079  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.78 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  35 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  29.91 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  35 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  35 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  39.42 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2071  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.23 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000425101  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  43.33 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.37 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.69336  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1311  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.16 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.16 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.167435  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.23 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  34.06 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.54 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2066  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.45 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.54 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2847  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.16 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.170371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.62 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2861  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.51 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0308666  decreased coverage  0.000000000135895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 417 aa  54.3  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.97 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  40.32 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.71 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3160  methyltransferase type 12  38.89 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  0.0993246 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  23.58 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.3 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3361  methyltransferase type 12  40.48 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313906  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.06 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2800  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.17 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  30.12 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  26.95 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  28.14 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01566  conserved hypothetical protein  32.69 
 
 		 279 aa  52.8  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145995  normal  0.121317 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  40.35 
 
 		 268 aa  52.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1730  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224217 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.64 
 
 		 242 aa  52.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3270  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.13 
 
 		 241 aa  52.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0514123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.53 
 
 		 247 aa  52  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  28.63 
 
 		 260 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 269 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 255 aa  52  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  28.38 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 275 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  29 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0298  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.09 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  31.03 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>