More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2128 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2128  methyltransferase type 11  100 
 
 
246 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.26918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  43.85 
 
 
246 aa  185  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  42.28 
 
 
255 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02460  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  46.56 
 
 
263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.712689  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  44.04 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.060018  normal  0.471088 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  42.08 
 
 
253 aa  171  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.78 
 
 
250 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  40.5 
 
 
253 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  38.78 
 
 
242 aa  165  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  41.6 
 
 
249 aa  162  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2138  Methyltransferase type 11  38.91 
 
 
260 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3818  methyltransferase type 12  38.96 
 
 
250 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329874  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  36.44 
 
 
246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4660  methyltransferase type 12  39.11 
 
 
250 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3703  methyltransferase type 12  39.11 
 
 
250 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.919771  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5594  Methyltransferase type 11  40.57 
 
 
249 aa  145  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709179  normal  0.912769 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0586  Methyltransferase type 12  37.95 
 
 
239 aa  139  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2057  Methyltransferase type 12  37.11 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21030  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.95 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  29.65 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  25.19 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  25.19 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  23.85 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  24.42 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  23.85 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  25.23 
 
 
239 aa  77  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  24.52 
 
 
256 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  24.68 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  23.35 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  29.46 
 
 
248 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  23.21 
 
 
232 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  33.08 
 
 
262 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  25.82 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14490  hypothetical protein  38.55 
 
 
130 aa  61.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.157587 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0677  Methyltransferase type 11  25.33 
 
 
233 aa  61.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  39.09 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  23.5 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4035  methyltransferase type 11  42.74 
 
 
203 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.237399  normal  0.211519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  32 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 
253 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  29.55 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  30.24 
 
 
253 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  31.91 
 
 
208 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  25.86 
 
 
243 aa  58.5  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  31.25 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1427  Methyltransferase type 11  23.05 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.527187  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  24.64 
 
 
253 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  28.44 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  40.46 
 
 
178 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  24.39 
 
 
244 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  45.45 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.33 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  28.02 
 
 
271 aa  56.6  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  30.99 
 
 
239 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  27.67 
 
 
251 aa  56.2  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  21.97 
 
 
250 aa  55.5  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  46.3 
 
 
275 aa  55.8  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  23.74 
 
 
252 aa  55.5  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  30.74 
 
 
575 aa  55.5  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  32.46 
 
 
236 aa  55.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  28.96 
 
 
246 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  54.17 
 
 
291 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1911  Methyltransferase type 11  22.27 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  28.17 
 
 
262 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0632  type 11 methyltransferase  37.04 
 
 
204 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.186651 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  32.68 
 
 
310 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4405  Methyltransferase type 11  50.68 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.432448  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.52 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2718  Methyltransferase type 12  34.85 
 
 
204 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  24.48 
 
 
272 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 
266 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  28.14 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  23.36 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  34.53 
 
 
240 aa  52.8  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  29.59 
 
 
253 aa  52.8  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 
220 aa  52.8  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  31.88 
 
 
238 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  31.88 
 
 
238 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  36.99 
 
 
251 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  34.71 
 
 
199 aa  52.4  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.14 
 
 
259 aa  52.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
299 aa  52.4  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2192  methyltransferase type 11  37.93 
 
 
279 aa  52.4  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  32.99 
 
 
259 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  44.64 
 
 
273 aa  52  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1258  Methyltransferase type 11  22.62 
 
 
245 aa  52  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.760119 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.35 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  30.67 
 
 
268 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  40.83 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.7 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  27.68 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.17 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2432  methyltransferase type 11  46.88 
 
 
259 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  32.5 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  32.5 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2150  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.08 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  32.5 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>