More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5594 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5594  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 249 aa  495  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709179  normal  0.912769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  59.75 
 
 		 242 aa  278  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  60.08 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  54.55 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.060018  normal  0.471088 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2138  Methyltransferase type 11  48.59 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  42.34 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02460  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  45.34 
 
 		 263 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.712689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2128  methyltransferase type 11  40.57 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.26918 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  38.46 
 
 		 253 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  38.07 
 
 		 253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.95 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21030  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  43.72 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  37.22 
 
 		 255 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3818  methyltransferase type 12  37.67 
 
 		 250 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4660  methyltransferase type 12  37.95 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3703  methyltransferase type 12  37.95 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.919771  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  37.23 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2057  Methyltransferase type 12  38.91 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0586  Methyltransferase type 12  33.64 
 
 		 239 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  32.82 
 
 		 239 aa  97.8  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  28.72 
 
 		 251 aa  85.1  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  27.56 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  27.56 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  26.82 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  26.82 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  26.13 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  25.56 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  40.2 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  26.58 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2108  hypothetical protein  39.07 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3485  Methyltransferase type 11  37.6 
 
 		 246 aa  62  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2432  methyltransferase type 11  33.8 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  34.29 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  27.54 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.08 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  38.04 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3137  Methyltransferase type 11  35.54 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4035  methyltransferase type 11  41.51 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.237399  normal  0.211519 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  27.36 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  25.64 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  41.51 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  32.95 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  32.95 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  26.17 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  35.34 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  35.92 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.17 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  35.71 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  44.62 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.05 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  36.51 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  36.7 
 
 		 329 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4416  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  36.79 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  37.07 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  30.18 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  36.69 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  22.95 
 
 		 232 aa  53.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  24.88 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  29.28 
 
 		 262 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 260 aa  52.4  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 268 aa  52.4  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3270  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.01 
 
 		 241 aa  52.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0514123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.37 
 
 		 235 aa  52  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.126123  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  25.1 
 
 		 272 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  31.37 
 
 		 199 aa  52  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.08 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.846293 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  26.15 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  34.95 
 
 		 274 aa  51.2  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  25.23 
 
 		 276 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  39.32 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  29.47 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  26.56 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  23.27 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.24 
 
 		 155 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  23.16 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.58 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0120  Methyltransferase type 12  34.76 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 226 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  30.15 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1615  methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 196 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 316 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  22.8 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 266 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2984  methyltransferase type 11  36.6 
 
 		 227 aa  50.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3404  methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 226 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  32.2 
 
 		 629 aa  49.7  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>