More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1651 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 260 aa  526  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  33.46 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  31.3 
 
 		 248 aa  129  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 247 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  37.17 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  29.26 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  29.79 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  32.31 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  29.03 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  29.03 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  28.23 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  28.23 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  28.23 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  28.23 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  28.23 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  27.82 
 
 		 249 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  27.82 
 
 		 249 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  28.57 
 
 		 247 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  27.42 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  26.32 
 
 		 238 aa  99  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  26.32 
 
 		 238 aa  99  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  30.86 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  31.47 
 
 		 244 aa  97.1  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2188  methyltransferase type 11  33.2 
 
 		 294 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  29.72 
 
 		 276 aa  92.8  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  29.28 
 
 		 233 aa  88.6  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  30.48 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  28.63 
 
 		 244 aa  85.5  7e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  29.57 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  23.58 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  27.95 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  28 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1869  hypothetical protein  25.69 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2158  hypothetical protein  25.69 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2042  methyltransferase type 11  30.04 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  27.53 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  28.21 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  29.69 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0998  Methyltransferase type 11  29.15 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  29.39 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  35 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  26.92 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  26.44 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  26.44 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  26.44 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1565  methyltransferase type 11  25.35 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.132389  hitchhiker  0.000000000856384 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1240  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  26.67 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09870  hypothetical protein  29.17 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.261813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  29.38 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  25.64 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  26.05 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  25.68 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  25 
 
 		 237 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1549  methyltransferase type 11  28.05 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  31.72 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  24.24 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2637  methyltransferase type 12  27.33 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325203  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4536  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1418  Methyltransferase type 11  28.09 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  25.45 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  30.07 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2460  hypothetical protein  27.54 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.171848  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  22.64 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  25.51 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1427  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.527187  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  23.26 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0677  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0501  methyltransferase type 11  25.9 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  24.34 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3449  methyltransferase type 11  25.9 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  29.57 
 
 		 541 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2180  methyltransferase type 12  28.78 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  24.36 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3161  methyltransferase type 12  28.78 
 
 		 247 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.086147 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  24.58 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1608  hypothetical protein  22.58 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4069  hypothetical protein  25.79 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  27.34 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4043  Methyltransferase type 11  27.67 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1985  Methyltransferase type 12  36.97 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.491652 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04339  methyltransferase  29.47 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  27.83 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0078  methyltransferase type 11  29.48 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682251  hitchhiker  0.000120825 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  26.64 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  28.19 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  27.84 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  28.19 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3653  methyltransferase type 12  23.04 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4001  Methyltransferase type 11  27.96 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>