More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2042 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2042  methyltransferase type 11  100 
 
 
256 aa  520  1e-147  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646082  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  32.3 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  33.49 
 
 
266 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  33.64 
 
 
248 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  28.19 
 
 
248 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  25.85 
 
 
232 aa  99  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
249 aa  99  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  34.1 
 
 
254 aa  99  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  28.35 
 
 
249 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  28.8 
 
 
249 aa  95.5  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  28.46 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  28.46 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  28.46 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  28.46 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  28.46 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  27.95 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  33.77 
 
 
269 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  28.02 
 
 
269 aa  92.8  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  28.63 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  28.63 
 
 
249 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  28.63 
 
 
276 aa  90.5  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  32.57 
 
 
244 aa  90.1  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2188  methyltransferase type 11  34.5 
 
 
294 aa  89.4  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1869  hypothetical protein  28.29 
 
 
245 aa  88.2  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  27.45 
 
 
244 aa  87.4  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2158  hypothetical protein  28.85 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  27.35 
 
 
233 aa  85.5  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  26.91 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  28.24 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  30.04 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1240  Methyltransferase type 11  23.98 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  34.89 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  34.44 
 
 
237 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  31.87 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  33.78 
 
 
257 aa  72  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  35.56 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  31.98 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  35.4 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  24.61 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  24.61 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  30.05 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  34.06 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  25.97 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  24.79 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  34.82 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  35.4 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  33.76 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  34.82 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  30 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09870  hypothetical protein  33.33 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.261813  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  27.95 
 
 
276 aa  67  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  34.51 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  34.51 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4536  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  27.27 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1565  methyltransferase type 11  28.26 
 
 
247 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.132389  hitchhiker  0.000000000856384 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0602  methyltransferase type 11  25.88 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445772  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3653  methyltransferase type 12  29.71 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  26.79 
 
 
244 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  43.69 
 
 
242 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  34.23 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4069  hypothetical protein  26.58 
 
 
261 aa  63.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1549  methyltransferase type 11  28.75 
 
 
255 aa  63.9  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3449  methyltransferase type 11  26.58 
 
 
261 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0501  methyltransferase type 11  26.58 
 
 
263 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2180  methyltransferase type 12  27.62 
 
 
247 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  25.32 
 
 
248 aa  62.8  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2798  Methyltransferase type 12  39.25 
 
 
237 aa  62.4  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0280553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  29.79 
 
 
254 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  40.82 
 
 
233 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  29.58 
 
 
262 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0543  methyltransferase type 11  28.99 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  36.51 
 
 
245 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0629  hypothetical protein  36.7 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.41007  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4457  hypothetical protein  29.29 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.643189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4271  hypothetical protein  29.29 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208511  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3796  methyltransferase type 11  28.26 
 
 
285 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4508  hypothetical protein  29.29 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4603  hypothetical protein  29.29 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.964338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4455  hypothetical protein  29.29 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.821165 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4222  methyltransferase type 11  29.29 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0521  methyltransferase type 11  28.26 
 
 
285 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  25.1 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0547  Methyltransferase type 11  28.26 
 
 
285 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4494  hypothetical protein  29.29 
 
 
212 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  32.33 
 
 
152 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0742  hypothetical protein  29.29 
 
 
212 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  24.89 
 
 
250 aa  59.7  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2637  methyltransferase type 12  28.99 
 
 
250 aa  59.7  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325203  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  28.79 
 
 
253 aa  59.3  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3161  methyltransferase type 12  30.43 
 
 
247 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.086147 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  24.02 
 
 
246 aa  58.5  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  28.22 
 
 
249 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  34.09 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0013  hypothetical protein  29.93 
 
 
260 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  28.05 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>