More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1232 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  100 
 
 		 246 aa  516  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  43.03 
 
 		 276 aa  218  7e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  41.39 
 
 		 244 aa  206  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  41.06 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  39.84 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  42.68 
 
 		 250 aa  180  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  36 
 
 		 247 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  35.86 
 
 		 249 aa  148  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  36.8 
 
 		 249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  36.8 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  34.4 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  35.2 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  35.2 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  35.6 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  35.6 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  35.6 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  35.6 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  35.6 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  34.43 
 
 		 238 aa  135  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  34.43 
 
 		 238 aa  135  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  30.33 
 
 		 239 aa  126  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0998  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  28.23 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  28.69 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1869  hypothetical protein  30.04 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  29.82 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2158  hypothetical protein  30.04 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  31.31 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  26.61 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 247 aa  86.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1240  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  25 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  26.19 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6748  Methyltransferase type 11  30.2 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  22.45 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  23.98 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  27.43 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2422  methyltransferase  33.02 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.440129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4536  methyltransferase type 11  27.35 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  24.69 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  27.51 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  28.18 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  25 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  28.1 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0179  Methyltransferase type 12  34.31 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2906  hypothetical protein  32.79 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  26.29 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2616  methyltransferase  32.79 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183675  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1181  methyltransferase type 12  26.27 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  23.38 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2863  hypothetical protein  32.79 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276445 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  24.86 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2664  hypothetical protein  32.79 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182246  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2585  methyltransferase  33.94 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2858  hypothetical protein  32.79 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2888  hypothetical protein  31.97 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177004  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  24.06 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1678  methyltransferase type 12  26.97 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0186038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2872  hypothetical protein  30.84 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  24.06 
 
 		 262 aa  62  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0124  hypothetical protein  26.11 
 
 		 416 aa  62  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0746  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 		 254 aa  62  0.000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0193664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17011  glycine-sarcosine methyltransferase  33.33 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  25.68 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  24.41 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2856  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1452  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.438518  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  29.85 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  22.82 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  25.56 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2662  methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2188  methyltransferase type 11  24.73 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  27.84 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  29.79 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  29.79 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0078  methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682251  hitchhiker  0.000120825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 675 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  23.71 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 572 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2749  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1608  hypothetical protein  24.11 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  24.68 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  30.94 
 
 		 559 aa  56.2  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  23.17 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  26.94 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3970  methyltransferase type 11  24.77 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  normal  0.529582 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2310  hypothetical protein  28.47 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00350604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2485  hypothetical protein  28.47 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000990951  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2777  methyltransferase type 11  28.49 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0205  hypothetical protein  33.64 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0716517  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2206  Methyltransferase type 11  20.66 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000097592  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>