109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0205 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0205  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  524  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0716517  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  29.65 
 
 
258 aa  85.5  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2888  hypothetical protein  25 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2585  methyltransferase  23.76 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2664  hypothetical protein  23.27 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2858  hypothetical protein  23.27 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2863  hypothetical protein  23.27 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276445 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2616  methyltransferase  23.27 
 
 
254 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183675  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2906  hypothetical protein  24.44 
 
 
254 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2662  methyltransferase type 11  25.41 
 
 
252 aa  62  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2872  hypothetical protein  23.89 
 
 
253 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7298  hypothetical protein  32.84 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4138  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 
254 aa  60.1  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604904  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  33.12 
 
 
315 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2606  hypothetical protein  29.39 
 
 
262 aa  58.9  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3271  Methyltransferase type 12  32.56 
 
 
238 aa  58.9  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.128592 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  27.04 
 
 
249 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2108  hypothetical protein  31.91 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162717  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  27.04 
 
 
249 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2422  methyltransferase  23.89 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.440129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4547  methyltransferase type 11  35.85 
 
 
254 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577153  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  27.04 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  27.04 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  27.04 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  27.04 
 
 
249 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
249 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  27.04 
 
 
249 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 
257 aa  56.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  27.88 
 
 
239 aa  56.2  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  30.77 
 
 
250 aa  55.5  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3137  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
251 aa  55.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0127  methyltransferase type 12  27.27 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  30.56 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  30.09 
 
 
238 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  30.09 
 
 
238 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl078  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  24.37 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0153588  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7150  methyltransferase  32.71 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  33.64 
 
 
246 aa  53.9  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2749  Methyltransferase type 11  26.37 
 
 
252 aa  52.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4176  methyltransferase type 11  31.03 
 
 
256 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000140176  hitchhiker  0.0000000044225 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3335  Methyltransferase type 12  27.03 
 
 
259 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.15309  unclonable  0.0000000176588 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  28.04 
 
 
249 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  28.8 
 
 
284 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0182  hypothetical protein  39.13 
 
 
241 aa  50.4  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.168407  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  28.04 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1427  Methyltransferase type 11  27.1 
 
 
237 aa  50.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.527187  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
253 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  26.02 
 
 
251 aa  49.7  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  30.49 
 
 
267 aa  49.3  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4043  Methyltransferase type 11  24.54 
 
 
248 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  28.85 
 
 
249 aa  49.3  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4001  Methyltransferase type 11  24.54 
 
 
248 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2351  methyltransferase type 11  35.94 
 
 
263 aa  48.9  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0117235  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1246  methyltransferase  30.7 
 
 
253 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1814  methyltransferase type 12  30.34 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  27.64 
 
 
260 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  32.54 
 
 
270 aa  46.6  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  25.23 
 
 
250 aa  45.8  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1869  hypothetical protein  34.31 
 
 
245 aa  45.8  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1240  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 
242 aa  45.8  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3478  hypothetical protein  31.31 
 
 
257 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0815915 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  33.05 
 
 
575 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2133  tellurite resistance protein TehB  29.14 
 
 
295 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2856  methyltransferase type 12  32.04 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2139  tellurite resistance protein TehB  29.14 
 
 
295 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2243  tellurite resistance protein TehB  29.14 
 
 
295 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  39.02 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
271 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 
216 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  36.04 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2563  Methyltransferase type 12  31.15 
 
 
246 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  28.12 
 
 
253 aa  45.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2158  hypothetical protein  32.69 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  26.67 
 
 
275 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33100  methyltransferase family protein  32.73 
 
 
267 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119457  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  27.34 
 
 
252 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  20.64 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  29.87 
 
 
294 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09370  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  35.19 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.963324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  33.66 
 
 
248 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  39.29 
 
 
279 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  32.46 
 
 
207 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  29.36 
 
 
251 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  46.88 
 
 
276 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2798  Methyltransferase type 12  29.79 
 
 
237 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0280553  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0474  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.07 
 
 
257 aa  43.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  25.71 
 
 
269 aa  43.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  28.36 
 
 
275 aa  43.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  33.64 
 
 
247 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3812  dimethyladenosine transferase  34.38 
 
 
356 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.433637  hitchhiker  0.00916806 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  50.85 
 
 
252 aa  42.7  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07800  methyltransferase family protein  33.01 
 
 
261 aa  43.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.93 
 
 
259 aa  42.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  29.36 
 
 
240 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  32 
 
 
264 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6712  methyltransferase type 12  32.11 
 
 
237 aa  42.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>