77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2563 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2563  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 246 aa  516  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3753  methyltransferase type 12  50.62 
 
 		 242 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5240  hypothetical protein  51.03 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.313704  normal  0.432968 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3018  hypothetical protein  35.8 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3192  methyltransferase type 12  29.27 
 
 		 243 aa  105  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0280  hypothetical protein  25.96 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.13  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3118  methyltransferase type 12  28.92 
 
 		 246 aa  93.6  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0061861  hitchhiker  0.0013011 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0192  hypothetical protein  28.37 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1615  hypothetical protein  32.35 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  32.67 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1135  putative NDP-hexose methyltransferase protein  37.21 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  31.62 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  28.49 
 
 		 1509 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  33.08 
 
 		 318 aa  53.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  25.48 
 
 		 303 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  31.68 
 
 		 382 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 330 aa  50.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  28.81 
 
 		 358 aa  49.3  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  27.27 
 
 		 323 aa  49.3  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2318  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  32.67 
 
 		 359 aa  48.5  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.300919  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  29.19 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14071  hypothetical protein  33.33 
 
 		 354 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0536684  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1633  HAD-superfamily phosphatase subfamily IIIC/FkbH domain-containing protein  28.81 
 
 		 897 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0549142  normal  0.0235477 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2106  methyltransferase type 12  30.36 
 
 		 565 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1042  hypothetical protein  35.59 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3781  methyltransferase type 11  29.67 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 317 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 361 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  27.19 
 
 		 310 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  30.51 
 
 		 672 aa  46.2  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 333 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1427  methyltransferase type 12  23.96 
 
 		 251 aa  45.8  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  25.95 
 
 		 286 aa  45.8  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 326 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  26 
 
 		 297 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  29.82 
 
 		 273 aa  44.7  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0205  hypothetical protein  31.15 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0716517  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1402  Methyltransferase type 11  26.45 
 
 		 394 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  29 
 
 		 332 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  29.2 
 
 		 306 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1355  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.632641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  27.62 
 
 		 308 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 711 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.317292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4464  Methyltransferase type 12  26.34 
 
 		 543 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  33.33 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3380  Methyltransferase type 12  28.28 
 
 		 391 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  29.67 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  25.86 
 
 		 299 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  29.09 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 298 aa  43.5  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  33.01 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.5 
 
 		 1561 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 323 aa  43.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 323 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.97 
 
 		 238 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  29.57 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  21.43 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  21.43 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  21.43 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  24.04 
 
 		 342 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4115  methyltransferase type 12  26.8 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  21.43 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  21.43 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  21.43 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  21.43 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 326 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  23.57 
 
 		 309 aa  42.7  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 309 aa  42.7  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3087  methyltransferase type 11  32 
 
 		 212 aa  42.7  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01042  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  25.35 
 
 		 331 aa  42.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 339 aa  42  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  24.46 
 
 		 309 aa  42  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 327 aa  42  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>