93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0182 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0182  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  488  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.168407  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1575  hypothetical protein  46.5 
 
 
242 aa  206  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00527276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2485  hypothetical protein  42.36 
 
 
252 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0677  Methyltransferase type 11  28.79 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3271  Methyltransferase type 12  42.59 
 
 
238 aa  65.1  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.128592 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  30.83 
 
 
258 aa  59.7  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  28.49 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3137  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
251 aa  55.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  29.52 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  25.59 
 
 
247 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2206  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 
269 aa  52  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000097592  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  34.93 
 
 
315 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
248 aa  51.2  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2856  methyltransferase type 12  32.61 
 
 
269 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  29.51 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0205  hypothetical protein  37.5 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0716517  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  25 
 
 
244 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  29.2 
 
 
244 aa  50.1  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1678  methyltransferase type 12  31.52 
 
 
268 aa  50.4  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0186038  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1258  Methyltransferase type 11  26.19 
 
 
245 aa  49.7  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.760119 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3114  Methyltransferase type 12  31.82 
 
 
247 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  29.68 
 
 
296 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  29.09 
 
 
233 aa  49.3  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  32.04 
 
 
250 aa  49.3  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  45.76 
 
 
200 aa  48.9  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7150  methyltransferase  33.66 
 
 
249 aa  48.9  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.48 
 
 
250 aa  48.9  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0179  Methyltransferase type 12  33.7 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  32.35 
 
 
559 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  32.21 
 
 
183 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  39.29 
 
 
177 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4859  hypothetical protein  28.68 
 
 
254 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.069885 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1181  methyltransferase type 12  30.77 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  27.18 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3485  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
246 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  30.77 
 
 
266 aa  47  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  27.81 
 
 
259 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  26.85 
 
 
248 aa  46.2  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  30.95 
 
 
255 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  22.91 
 
 
276 aa  46.2  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  19.05 
 
 
241 aa  46.2  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  48 
 
 
267 aa  45.8  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2108  hypothetical protein  31.93 
 
 
247 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162717  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 
572 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  22.44 
 
 
250 aa  45.4  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1909  methyltransferase type 11  34.15 
 
 
560 aa  45.4  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  38.24 
 
 
220 aa  45.8  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  29.22 
 
 
246 aa  45.8  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4138  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 
254 aa  45.8  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604904  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  38.24 
 
 
575 aa  45.4  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  34.26 
 
 
275 aa  45.4  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
251 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 
218 aa  45.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
199 aa  45.4  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
305 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6748  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 
267 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1911  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
231 aa  45.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3934  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229133  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17011  glycine-sarcosine methyltransferase  28.93 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.77 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  40.62 
 
 
286 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3335  Methyltransferase type 12  29.13 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.15309  unclonable  0.0000000176588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  26.24 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  23 
 
 
269 aa  43.5  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  34.43 
 
 
198 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  41.54 
 
 
226 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 
251 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0420  hypothetical protein  30.48 
 
 
312 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  30.69 
 
 
429 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2657  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 
216 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  28.79 
 
 
223 aa  43.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl078  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  26.85 
 
 
307 aa  42.7  0.005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0153588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  37.84 
 
 
292 aa  42.7  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
218 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1057  Methyltransferase type 12  27.78 
 
 
254 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  34.53 
 
 
246 aa  42.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  34.71 
 
 
208 aa  42.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  29.68 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2289  hypothetical protein  33.59 
 
 
229 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.811706  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  42.11 
 
 
289 aa  42.4  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  28 
 
 
220 aa  42.7  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09370  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  31.03 
 
 
256 aa  42.4  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.963324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
269 aa  42.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.39 
 
 
251 aa  42.4  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
252 aa  42  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 
202 aa  42  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0145  thiopurine S-methyltransferase  31.82 
 
 
210 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285436  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4504  methyltransferase type 12  29.61 
 
 
198 aa  42  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210014  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  29.88 
 
 
410 aa  42  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04339  methyltransferase  33.01 
 
 
261 aa  42  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  28.88 
 
 
262 aa  42  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  34.55 
 
 
248 aa  41.6  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>