52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3934 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3934  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 259 aa  508  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229133  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0102  Methyltransferase type 11  27.32 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0888112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0963  SAM-dependent methyltransferase  26.19 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.679672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0485  methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09363  putative methyltransferase  27.62 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.182013  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0660  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1767  hypothetical protein  32.28 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00475072 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2162  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0386731 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  40 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  40 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2920  Methyltransferase type 12  31.11 
 
 		 223 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  38.13 
 
 		 252 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2092  hypothetical protein  35.19 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.516307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4493  hypothetical protein  25.98 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.809793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3732  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0726  methyltransferase type 12  31.34 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204789  normal  0.0433618 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0706  methyltransferase type 12  31.34 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0371032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0712  methyltransferase type 12  31.34 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.897231  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  39.18 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  34 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3091  Methyltransferase type 11  37.29 
 
 		 227 aa  49.3  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.974838 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0888  methyltransferase type 12  31.11 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  31.89 
 
 		 202 aa  46.6  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  39.19 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5054  HemK family modification methylase  39.39 
 
 		 284 aa  45.4  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244317  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7889  methyltransferase small  40.51 
 
 		 299 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2139  tellurite resistance protein TehB  23.21 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2243  tellurite resistance protein TehB  23.21 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  55.26 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0182  hypothetical protein  32.41 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.168407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1149  methyltransferase type 12  22.22 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2133  tellurite resistance protein TehB  23.21 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  37.14 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1721  Methyltransferase type 11  34.52 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.204  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  30.21 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  25.55 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 199 aa  43.5  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33100  methyltransferase family protein  31.15 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119457  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  35.19 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  33 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1911  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 250 aa  42.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  39.39 
 
 		 273 aa  42.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2488  methyltransferase type 11  38.16 
 
 		 223 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.69 
 
 		 242 aa  42  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.167435  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1311  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.69 
 
 		 242 aa  42  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf339  predicted O-methyltransferase  27.66 
 
 		 242 aa  42.4  0.009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00322712  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2847  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.69 
 
 		 242 aa  42  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.170371  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2138  Methyltransferase type 11  55.56 
 
 		 260 aa  42  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1752  putative methyltransferase  31.03 
 
 		 253 aa  42  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.610135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>