More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2002 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  604  9.999999999999999e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  60.53 
 
 
267 aa  347  2e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  51.93 
 
 
288 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  48.94 
 
 
284 aa  299  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  40.21 
 
 
284 aa  225  7e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  32.74 
 
 
294 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  33.92 
 
 
299 aa  158  9e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  31.5 
 
 
286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  28.95 
 
 
292 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  26.26 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.46 
 
 
275 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  26.67 
 
 
270 aa  101  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0487  Methyltransferase type 11  24.9 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000866959 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  30.87 
 
 
270 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2634  hypothetical protein  24.25 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.167376  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  27.48 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  25.86 
 
 
286 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  31.08 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  26.14 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  29.5 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  33.08 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  32.14 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  29.38 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  27.35 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  24.44 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.95 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  26.55 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  27.19 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  28.25 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.21 
 
 
352 aa  66.6  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  25.51 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  25.49 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  30.19 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  29.34 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  25.56 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  37.25 
 
 
291 aa  65.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  29.33 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  39.22 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  26.67 
 
 
269 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  25.09 
 
 
268 aa  63.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  27.91 
 
 
240 aa  63.2  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 
255 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  23.25 
 
 
268 aa  60.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  26.54 
 
 
291 aa  60.1  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  34.55 
 
 
258 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  30.4 
 
 
276 aa  59.7  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  32.81 
 
 
268 aa  59.3  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  25.79 
 
 
279 aa  59.3  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  49.15 
 
 
232 aa  58.9  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  37.11 
 
 
319 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 
258 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  28.12 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  34.13 
 
 
220 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  22.89 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.25 
 
 
263 aa  57  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  31.54 
 
 
280 aa  56.6  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  30 
 
 
264 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.45 
 
 
250 aa  56.2  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  34.55 
 
 
265 aa  55.8  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.5 
 
 
230 aa  55.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.06 
 
 
272 aa  55.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  29.77 
 
 
232 aa  55.5  0.0000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  32.38 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  33.33 
 
 
223 aa  55.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  34.41 
 
 
255 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  37.08 
 
 
226 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
244 aa  54.7  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  29.14 
 
 
271 aa  54.7  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  23.96 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  52.94 
 
 
232 aa  53.9  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 
262 aa  54.3  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  34.09 
 
 
266 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13560  Tellurite resistance protein TehB  35.87 
 
 
117 aa  53.5  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  25.2 
 
 
266 aa  53.5  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  34.78 
 
 
241 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  30.08 
 
 
225 aa  53.1  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  36.04 
 
 
190 aa  53.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  46.55 
 
 
581 aa  53.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  22.27 
 
 
239 aa  52.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  28.3 
 
 
274 aa  53.1  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  39.47 
 
 
286 aa  52.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
265 aa  52.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  53.49 
 
 
246 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.29 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  27.38 
 
 
226 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  23.64 
 
 
287 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  26.15 
 
 
293 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
293 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  38.36 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0403  putative methyltransferase  29.03 
 
 
210 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00297063  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  47.17 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  47.17 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  35.29 
 
 
278 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  43.24 
 
 
189 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  37.21 
 
 
275 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  32.98 
 
 
243 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
244 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  37.21 
 
 
275 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  28.07 
 
 
248 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>