More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23110 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  100 
 
 
223 aa  438  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  77.44 
 
 
410 aa  279  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  56.81 
 
 
227 aa  198  7e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  57.5 
 
 
226 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  46.48 
 
 
221 aa  159  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  51.02 
 
 
198 aa  155  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  43.12 
 
 
544 aa  148  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  47 
 
 
196 aa  141  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  44.17 
 
 
208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  42.57 
 
 
253 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  43.63 
 
 
210 aa  118  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  46.15 
 
 
218 aa  118  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  47.42 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  41.89 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  39.19 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  42.16 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  36.89 
 
 
227 aa  108  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  39.13 
 
 
204 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  40.39 
 
 
211 aa  105  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  40.1 
 
 
211 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  39.53 
 
 
243 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3264  methyltransferase type 12  39.05 
 
 
210 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  40.53 
 
 
221 aa  97.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  43.59 
 
 
215 aa  96.7  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  36.7 
 
 
217 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3908  methyltransferase type 12  44.23 
 
 
189 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29001  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  39 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  39.86 
 
 
226 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  42.22 
 
 
206 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  36.5 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  39.26 
 
 
197 aa  85.1  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  32.98 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0214  Methyltransferase type 11  43.36 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0641979  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  40.74 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
218 aa  82  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  39.22 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  39.73 
 
 
205 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  39.73 
 
 
205 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  39.73 
 
 
205 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  38.62 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  39.67 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  42.03 
 
 
208 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  33.89 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  39.55 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2302  hypothetical protein  35.11 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  35.82 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  33.59 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  34.22 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  35.25 
 
 
190 aa  72  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2657  Methyltransferase type 11  34.8 
 
 
216 aa  72  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  29.46 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  27.13 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  27.13 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  38.31 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  33.9 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  29.46 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  29.46 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  35.81 
 
 
396 aa  69.3  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  29.32 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  34.85 
 
 
200 aa  67.8  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 
199 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  30.65 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  30.73 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  32.99 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  34.59 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  35.46 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0609  Methyltransferase type 12  39.58 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.763515  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  35.82 
 
 
196 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5269  Methyltransferase type 12  43.64 
 
 
219 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  34.86 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  32.94 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  30.14 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
190 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
277 aa  62.8  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
284 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
243 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  32.17 
 
 
247 aa  62.4  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  34.35 
 
 
200 aa  62.4  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  32.76 
 
 
290 aa  62  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2087  Methyltransferase type 11  41.78 
 
 
221 aa  62  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.261869 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  32.14 
 
 
194 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  33.82 
 
 
190 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  32.14 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  30.82 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  36.8 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0186  Methyltransferase type 11  35.38 
 
 
197 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  47.89 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3410  hypothetical protein  32.95 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.134016 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4951  Methyltransferase type 12  39.56 
 
 
204 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0197  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
197 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4471  methyltransferase type 11  31.79 
 
 
214 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00423193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2998  Methyltransferase type 11  44.6 
 
 
203 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527605  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
216 aa  59.7  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.36 
 
 
250 aa  58.9  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  34.75 
 
 
198 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  40.78 
 
 
200 aa  59.3  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  33.06 
 
 
149 aa  58.9  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  42.16 
 
 
225 aa  58.9  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>