82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2485 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2485  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  520  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1575  hypothetical protein  40.71 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00527276  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0182  hypothetical protein  42.36 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.168407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6748  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0179  Methyltransferase type 12  30.52 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1181  methyltransferase type 12  30.83 
 
 		 268 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2856  methyltransferase type 12  27.74 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1678  methyltransferase type 12  28.47 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0186038  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17011  glycine-sarcosine methyltransferase  28.21 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  24.82 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  27.85 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0677  Methyltransferase type 11  27.94 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  25.35 
 
 		 572 aa  55.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  24.52 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1911  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2397  Methyltransferase type 11  39.78 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000574494  decreased coverage  0.000150553 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  26.4 
 
 		 232 aa  52.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1648  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.53805  normal  0.884834 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  40 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  24.12 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  25.79 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  29.52 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  25.71 
 
 		 269 aa  49.3  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  41.67 
 
 		 294 aa  49.3  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0965  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.06 
 
 		 229 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1267  methyltransferase type 12  27.52 
 
 		 350 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0998  Methyltransferase type 11  38.75 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4433  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.71 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112508 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4371  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.71 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  24.79 
 
 		 559 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  42.11 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1601  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.16 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  40.32 
 
 		 265 aa  46.6  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3557  Methyltransferase type 11  26.52 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3899  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.51 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6712  methyltransferase type 12  28.81 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  40.51 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7688  methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 184 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  0.423955 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  25.66 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  23.12 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5088  methyltransferase type 12  28 
 
 		 348 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  26.81 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12451  hypothetical protein  24.66 
 
 		 348 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.741785 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  26.81 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  50 
 
 		 288 aa  45.8  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4469  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.95 
 
 		 228 aa  45.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 246 aa  45.4  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1608  hypothetical protein  25.53 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  27.62 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3271  Methyltransferase type 12  47.17 
 
 		 238 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.128592 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  29.17 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  25.34 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.76 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  31.82 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13560  Tellurite resistance protein TehB  37.88 
 
 		 117 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  23.49 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  35.29 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  30.52 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.93 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.89 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6413  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  39.36 
 
 		 233 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  37.29 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  31.78 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  52.38 
 
 		 274 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  28.08 
 
 		 675 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  40.91 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3415  magnesium protoporphyrin O-methyltransferase  28.57 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.762452  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11432  methyltransferase  42.19 
 
 		 274 aa  42.7  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000106328  normal  0.345839 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  38.1 
 
 		 233 aa  42.7  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  22.86 
 
 		 244 aa  42.7  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 226 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  23.73 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4859  hypothetical protein  25.32 
 
 		 254 aa  42.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.069885 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 189 aa  42.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 220 aa  42  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  27.36 
 
 		 247 aa  42  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1907  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  25 
 
 		 237 aa  42  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  35.37 
 
 		 274 aa  42  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2863  hypothetical protein  31.07 
 
 		 254 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276445 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  30.48 
 
 		 208 aa  42  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>