More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2996 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  100 
 
 		 273 aa  531  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  40.71 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  34.09 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  41.78 
 
 		 256 aa  115  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  35.02 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  32.43 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  33.72 
 
 		 247 aa  96.7  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 254 aa  95.9  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  36.41 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  40.27 
 
 		 260 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  29.96 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  33.72 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 256 aa  89.4  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  30.38 
 
 		 263 aa  89  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.54 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  33.47 
 
 		 254 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 256 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  41.48 
 
 		 263 aa  85.5  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  35.61 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  35.5 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  33.21 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  42.52 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  29.48 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  30.13 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  32.57 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  29.55 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2382  Methyltransferase type 11  42.04 
 
 		 495 aa  79  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  22.68 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  29.58 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  38 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5336  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  32.84 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 		 276 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  30.8 
 
 		 243 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  28.99 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.54 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  36.43 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  31.84 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  28.99 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  28.99 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  28.99 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  28.26 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3418  methyltransferase type 11  35.66 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268365  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2303  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0543227  normal  0.375483 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  23.76 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  37.59 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  34.13 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  27.54 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  37.12 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  29.08 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2477  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  24.85 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0976  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  21.26 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86084  methyltransferase  19.46 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255585 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  31.34 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  37 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  36 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4222  methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  30.4 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  36.97 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  32.75 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  34.35 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  27.81 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  28 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0742  hypothetical protein  31.78 
 
 		 212 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4457  hypothetical protein  30.84 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.643189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4271  hypothetical protein  30.84 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208511  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4603  hypothetical protein  30.84 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.964338  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4508  hypothetical protein  30.84 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4455  hypothetical protein  30.84 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.821165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4494  hypothetical protein  30.84 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  36.7 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  27.69 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  28.14 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  25.69 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10334  hypothetical protein  34.92 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.672272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.81 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  25.69 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  25.83 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  31.82 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  27.94 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3479  methyltransferase type 11  38.73 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0924796 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4119  hypothetical protein  29.91 
 
 		 212 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0995588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>