More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2303 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2303  Methyltransferase type 11  100 
 
 
190 aa  373  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0543227  normal  0.375483 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4328  Methyltransferase type 11  59.89 
 
 
188 aa  218  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4278  Methyltransferase type 11  59.89 
 
 
186 aa  218  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.867588  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3326  Methyltransferase type 11  59.36 
 
 
186 aa  209  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2464  Methyltransferase type 11  56.84 
 
 
187 aa  204  5e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3707  Methyltransferase type 11  54.26 
 
 
184 aa  194  6e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52514  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0437  Methyltransferase type 11  50 
 
 
189 aa  167  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.598014  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  30.34 
 
 
188 aa  82  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  30.12 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
199 aa  74.3  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0457  methyltransferase type 11  31.55 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1832  methyltransferase type 11  30.21 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  37.37 
 
 
265 aa  67  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0604  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  26.02 
 
 
208 aa  64.3  0.0000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  35.24 
 
 
213 aa  63.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  26.2 
 
 
190 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  34.53 
 
 
268 aa  62.4  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 
220 aa  62  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0017  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 
191 aa  62  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  26.14 
 
 
173 aa  61.6  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  40.18 
 
 
352 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  32 
 
 
237 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.32 
 
 
207 aa  58.9  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 
225 aa  58.5  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 
199 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  40.59 
 
 
269 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 
354 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  40.59 
 
 
269 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.43 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  32.54 
 
 
255 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
337 aa  55.5  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  32.72 
 
 
215 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  26.06 
 
 
265 aa  54.7  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1449  methyltransferase, putative  30.36 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  31.53 
 
 
260 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  26.03 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1330  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.97 
 
 
205 aa  53.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.283996  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  29.55 
 
 
261 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
328 aa  53.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  35.14 
 
 
276 aa  53.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 
200 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 
326 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 
200 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  35.85 
 
 
246 aa  52.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1066  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 
238 aa  52.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  41.75 
 
 
326 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
212 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_002936  DET0402  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.19 
 
 
200 aa  52.4  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  36.36 
 
 
243 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  31.78 
 
 
257 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  33.68 
 
 
255 aa  52.4  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  23.7 
 
 
279 aa  52.4  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  28.19 
 
 
206 aa  52  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  34.95 
 
 
275 aa  52  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  28.49 
 
 
365 aa  51.6  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  28.3 
 
 
243 aa  52  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
237 aa  51.6  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  32.69 
 
 
273 aa  51.6  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_345  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  25.4 
 
 
200 aa  51.2  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  34.34 
 
 
239 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  34.34 
 
 
239 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  34.34 
 
 
239 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  34.06 
 
 
270 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0381  methyltransferase type 11  25.4 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.01 
 
 
237 aa  50.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.95 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
326 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3929  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.2 
 
 
269 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  29.59 
 
 
259 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  32.64 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  37.62 
 
 
275 aa  50.1  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  30.28 
 
 
268 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 
244 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  35.92 
 
 
250 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.38 
 
 
259 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  35.92 
 
 
250 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  35.64 
 
 
250 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  35.64 
 
 
250 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  35.92 
 
 
250 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 
244 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1483  methyltransferase type 11  28.95 
 
 
885 aa  49.7  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  30.32 
 
 
275 aa  49.3  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.98 
 
 
250 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  33.86 
 
 
241 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  32.04 
 
 
250 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 
216 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  34.69 
 
 
271 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.97 
 
 
205 aa  48.9  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1591  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
229 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  35.45 
 
 
266 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  36.46 
 
 
290 aa  48.9  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  30.77 
 
 
272 aa  49.3  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 
256 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1030  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 
216 aa  49.3  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3404  methyltransferase type 11  28.24 
 
 
226 aa  48.5  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  33.05 
 
 
213 aa  48.9  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  34.04 
 
 
242 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>