177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5336 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5336  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  544  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671975  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  67.16 
 
 
273 aa  338  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  63 
 
 
284 aa  323  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  61.9 
 
 
275 aa  321  7e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  55.47 
 
 
275 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2382  Methyltransferase type 11  52.87 
 
 
495 aa  241  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571429  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5296  Methyltransferase type 11  48.91 
 
 
282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  39.6 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 
264 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  29.3 
 
 
259 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  24.38 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  26.8 
 
 
278 aa  89.4  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  33.07 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  30.57 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  36.81 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  39.53 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  42.28 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  38.52 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  33.07 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  36.76 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  39.84 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  38.13 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  38.73 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  33.83 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  27.8 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  36.03 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  32.28 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  32.28 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  32.28 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  35.88 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  31.78 
 
 
246 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  33.55 
 
 
263 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  35.07 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 
259 aa  62.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.95 
 
 
280 aa  62  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  31.34 
 
 
255 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  26.28 
 
 
251 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  26.28 
 
 
251 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  26.28 
 
 
251 aa  58.9  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  26.28 
 
 
251 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  34.11 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  43 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  25.55 
 
 
251 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3123  hypothetical protein  25.95 
 
 
189 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  33.86 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  41.76 
 
 
200 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  24.82 
 
 
251 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1457  Methyltransferase type 12  34.11 
 
 
248 aa  55.8  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.129024  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  34.96 
 
 
255 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  28.96 
 
 
252 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
259 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.05 
 
 
308 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  36.52 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.52 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  36.52 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  36.52 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  33.58 
 
 
271 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  36.52 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  36.52 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  36.07 
 
 
270 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  24.82 
 
 
251 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  31.65 
 
 
255 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  33.91 
 
 
292 aa  52.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  37.89 
 
 
251 aa  52.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1773  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.69 
 
 
265 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 
242 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  28.66 
 
 
341 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
238 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  27.15 
 
 
341 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  26.63 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5511  methyltransferase  27.97 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.139687  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 
254 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  32.2 
 
 
323 aa  50.4  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  36.63 
 
 
258 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  25.77 
 
 
267 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  29.14 
 
 
341 aa  50.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  28.87 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.53 
 
 
232 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530089  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  23.58 
 
 
243 aa  50.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  29.14 
 
 
341 aa  50.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  38.54 
 
 
268 aa  50.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  29.27 
 
 
341 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1985  Methyltransferase type 12  32.28 
 
 
253 aa  49.3  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.491652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 
256 aa  49.3  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
340 aa  49.3  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  30.94 
 
 
255 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
337 aa  48.9  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3418  methyltransferase type 11  37.29 
 
 
254 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268365  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  22.03 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10334  hypothetical protein  28.82 
 
 
208 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.672272 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  29.32 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6333  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00315247  hitchhiker  0.000727551 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  24.78 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  24.78 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>