190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5511 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5511  methyltransferase  100 
 
 
249 aa  520  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.139687  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29451  hypothetical protein  71.37 
 
 
249 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1418  putative methyltransferase  43.15 
 
 
259 aa  199  3e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.282901  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1752  putative methyltransferase  43.15 
 
 
253 aa  196  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.610135  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0313  putative methyltransferase  43.03 
 
 
257 aa  188  5.999999999999999e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.459942  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1629  hypothetical protein  41.92 
 
 
258 aa  176  5e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  34.66 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1419  putative methyltransferase  30.83 
 
 
257 aa  112  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.412346  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1753  putative methyltransferase  30.83 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.148038  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0312  hypothetical protein  38.28 
 
 
142 aa  86.7  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.763248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  31.71 
 
 
251 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  31.1 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  30.43 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  31.1 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  31.1 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  37.68 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  29.81 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  32.12 
 
 
251 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  37.16 
 
 
256 aa  75.1  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.24 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  35.61 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  30.21 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  29.15 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  30.83 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  29.15 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  30.68 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  35.48 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.64 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  35.38 
 
 
242 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  35.56 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  30.96 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 
252 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  30.41 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  33.87 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3418  methyltransferase type 11  32.33 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268365  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  38.02 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  35.48 
 
 
239 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  35.48 
 
 
239 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  33.87 
 
 
239 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  30.07 
 
 
257 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2192  methyltransferase type 11  29.51 
 
 
279 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  33.59 
 
 
243 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  22.44 
 
 
259 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.97 
 
 
280 aa  61.6  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  25.4 
 
 
267 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  33.59 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
259 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
245 aa  60.1  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  27.2 
 
 
261 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3499  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  35.88 
 
 
263 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  27.16 
 
 
254 aa  56.2  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3479  methyltransferase type 11  31.39 
 
 
252 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0924796 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  30.65 
 
 
255 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  27.74 
 
 
277 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  29.84 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  27.52 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 
256 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  26.85 
 
 
249 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
260 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 
223 aa  52.4  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0178  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
265 aa  52  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.74 
 
 
241 aa  52  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  28 
 
 
249 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  31.01 
 
 
209 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  29.6 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  28.86 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0069  demethylmenaquinone methyltransferase  31.93 
 
 
258 aa  50.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.51 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4884  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
260 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.321775  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  29.11 
 
 
266 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.51 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  34.86 
 
 
280 aa  49.3  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2382  Methyltransferase type 11  25.73 
 
 
495 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571429  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.08 
 
 
254 aa  48.9  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
254 aa  48.9  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  23.97 
 
 
273 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  26.58 
 
 
273 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5336  hypothetical protein  27.97 
 
 
274 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671975  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 
256 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  22.27 
 
 
277 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.55 
 
 
236 aa  47  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.26 
 
 
250 aa  47  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0393  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  29.31 
 
 
238 aa  47  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  26.4 
 
 
249 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
262 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  27.63 
 
 
249 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  26.23 
 
 
257 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0806  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  30.43 
 
 
231 aa  45.8  0.0006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.622934  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  28.83 
 
 
266 aa  45.8  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  23.05 
 
 
273 aa  45.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  26.46 
 
 
232 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3492  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  30.28 
 
 
248 aa  45.8  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0846  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 
251 aa  45.8  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>