16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3123 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3123  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  70.43 
 
 		 259 aa  278  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  32.8 
 
 		 264 aa  92.8  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  31.22 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  30.32 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  24.42 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  24.74 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5336  hypothetical protein  25.95 
 
 		 274 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 273 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  21.74 
 
 		 278 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5296  Methyltransferase type 11  24.58 
 
 		 282 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  27.75 
 
 		 275 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2382  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 495 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  24.85 
 
 		 260 aa  40.8  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6333  Methyltransferase type 11  48.72 
 
 		 259 aa  41.2  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00315247  hitchhiker  0.000727551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>