26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6333 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6333  Methyltransferase type 11  100 
 
 
259 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00315247  hitchhiker  0.000727551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  22.77 
 
 
277 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  25.21 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  24.67 
 
 
278 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 
248 aa  55.5  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
284 aa  53.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 
275 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2382  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
495 aa  52.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571429  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5296  Methyltransferase type 11  37.37 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
273 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  32.06 
 
 
257 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  22.22 
 
 
264 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  33.93 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 
245 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5548  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
211 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  31.19 
 
 
275 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  26.27 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 
263 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5511  methyltransferase  26.76 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.139687  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5336  hypothetical protein  34.04 
 
 
274 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671975  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4082  methyltransferase type 12  33.64 
 
 
198 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0341683  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29451  hypothetical protein  23.14 
 
 
249 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0397  Methyltransferase type 12  31.53 
 
 
259 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0388  Methyltransferase type 12  31.53 
 
 
259 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  34.15 
 
 
262 aa  42.4  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>