271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4082 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4082  methyltransferase type 12  100 
 
 
198 aa  396  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0341683  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36 
 
 
233 aa  109  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4583  Methyltransferase type 11  35.47 
 
 
220 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.130075 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5548  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 
211 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  35.27 
 
 
225 aa  102  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.36 
 
 
200 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.64 
 
 
268 aa  97.8  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1502  Methyltransferase type 12  36 
 
 
223 aa  95.1  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  33.33 
 
 
197 aa  89  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.33 
 
 
200 aa  85.5  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1197  Methyltransferase type 12  29.88 
 
 
289 aa  77  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12360  methyltransferase family protein  30.14 
 
 
203 aa  72  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661079  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1258  hypothetical protein  37.04 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  31.96 
 
 
259 aa  58.2  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 
239 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.77 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  38.24 
 
 
253 aa  55.5  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  30.84 
 
 
269 aa  55.1  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  37.76 
 
 
306 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  37.61 
 
 
228 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0628  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.63 
 
 
230 aa  53.1  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308347  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  32.08 
 
 
275 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2382  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 
495 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571429  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.15 
 
 
252 aa  53.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3404  methyltransferase type 11  35.64 
 
 
226 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5905  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 
245 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  33.33 
 
 
207 aa  51.6  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.73 
 
 
325 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.32 
 
 
238 aa  51.2  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2516  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.46 
 
 
242 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158942  normal  0.172126 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.43 
 
 
239 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.86 
 
 
234 aa  50.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2461  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.46 
 
 
242 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  normal  0.0528077 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.82 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2412  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.46 
 
 
242 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114708  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2620  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.46 
 
 
242 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0890164  normal  0.121795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  33.67 
 
 
273 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2503  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.46 
 
 
242 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2970  hypothetical protein  35.64 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  36.61 
 
 
457 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  31.48 
 
 
298 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.6 
 
 
238 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  25.49 
 
 
273 aa  49.3  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5352  methyltransferase type 11  32 
 
 
268 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3445  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 
269 aa  48.9  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2800  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.04 
 
 
242 aa  48.9  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  32.35 
 
 
331 aa  48.9  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  36.17 
 
 
252 aa  48.9  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.56 
 
 
242 aa  48.9  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02158  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.14 
 
 
240 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1427  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.58 
 
 
240 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000505917  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2383  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.14 
 
 
240 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679426  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 
264 aa  48.5  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.14 
 
 
240 aa  48.5  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  31.37 
 
 
309 aa  48.5  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.58 
 
 
240 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1419  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.14 
 
 
240 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287901 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.58 
 
 
240 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3366  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.58 
 
 
240 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1427  methyltransferase type 12  28.1 
 
 
251 aa  48.5  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02117  hypothetical protein  32.14 
 
 
240 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 
254 aa  48.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.79 
 
 
232 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.41 
 
 
249 aa  48.1  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.33 
 
 
234 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  33 
 
 
263 aa  48.1  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2790  methyltransferase, putative  34.26 
 
 
324 aa  48.1  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.383321  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1852  Cro/CI family transcriptional regulator  30.93 
 
 
642 aa  48.1  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.79 
 
 
232 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.97 
 
 
230 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.88 
 
 
230 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.29 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.78 
 
 
236 aa  47.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0533  type 12 methyltransferase  30.21 
 
 
260 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324241  decreased coverage  0.00341349 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.58 
 
 
235 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.61 
 
 
238 aa  47.8  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.23 
 
 
238 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.97 
 
 
246 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2580  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.78 
 
 
249 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  31.01 
 
 
291 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  27.74 
 
 
249 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  27.87 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9984  predicted protein  33.96 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0507609  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3270  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.58 
 
 
241 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0514123  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  26.57 
 
 
243 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  37 
 
 
259 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4744  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.04 
 
 
249 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.752989  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  28.69 
 
 
306 aa  46.6  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 
284 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.38 
 
 
235 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2323  hypothetical protein  32.5 
 
 
252 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.569628  normal  0.0283599 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.97 
 
 
242 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
276 aa  45.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0017  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 
191 aa  45.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  28.83 
 
 
206 aa  45.8  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  23 
 
 
277 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.59 
 
 
305 aa  45.4  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.67 
 
 
232 aa  45.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  31.79 
 
 
224 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>