151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1590 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  100 
 
 
298 aa  623  1e-177  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  70.71 
 
 
319 aa  432  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  53.71 
 
 
293 aa  308  8e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  47.35 
 
 
291 aa  269  4e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  42.45 
 
 
280 aa  192  5e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  36.67 
 
 
302 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  36.53 
 
 
279 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  34.32 
 
 
280 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  33.58 
 
 
278 aa  169  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  36.58 
 
 
276 aa  169  7e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  35.93 
 
 
287 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  36.36 
 
 
279 aa  165  8e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  33.95 
 
 
283 aa  161  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  35.74 
 
 
293 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  32.97 
 
 
291 aa  157  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  31.97 
 
 
278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  32.21 
 
 
274 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  31.65 
 
 
283 aa  150  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  33.96 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  34.4 
 
 
277 aa  140  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  34.47 
 
 
291 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  26.43 
 
 
283 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  30.71 
 
 
286 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  32.26 
 
 
286 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  28.52 
 
 
279 aa  96.7  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  32.17 
 
 
275 aa  92  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  30.77 
 
 
270 aa  90.1  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  34.2 
 
 
273 aa  87  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  33.68 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  30.95 
 
 
254 aa  85.1  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  30.67 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  32.96 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  26.59 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1224  hypothetical protein  26.91 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  28.57 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  29.43 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  31.6 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  29 
 
 
279 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  30.61 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  31.69 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  27.16 
 
 
268 aa  72  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  29.49 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  26.18 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0682  SAM-binding motif-containing protein  29.05 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.206315  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  26.54 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  36.46 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  35.54 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  29.17 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  27.68 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  25.11 
 
 
275 aa  65.1  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  29.33 
 
 
289 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  29.86 
 
 
294 aa  63.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  25 
 
 
284 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  30.37 
 
 
276 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  22.31 
 
 
279 aa  58.9  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  38 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  39.6 
 
 
222 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  30.53 
 
 
271 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  33.98 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.1 
 
 
291 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  25.5 
 
 
267 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2232  UbiE/COQ5 methyltransferase  22.97 
 
 
232 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.618001  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.43 
 
 
352 aa  53.9  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  36.71 
 
 
261 aa  53.1  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1418  putative methyltransferase  39.08 
 
 
259 aa  53.1  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.282901  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  28.3 
 
 
273 aa  53.1  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  27.14 
 
 
265 aa  52.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  32.94 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  24.4 
 
 
232 aa  51.2  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  31.68 
 
 
266 aa  51.6  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0455  methyltransferase type 11  41.27 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
245 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 
231 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.63 
 
 
222 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.63 
 
 
222 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1752  putative methyltransferase  35.11 
 
 
253 aa  50.4  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.610135  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 
274 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  40.24 
 
 
246 aa  49.7  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8959  hypothetical protein  26.84 
 
 
261 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
260 aa  49.3  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  23.81 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.77 
 
 
236 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  39.74 
 
 
249 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29633  predicted protein  32.19 
 
 
949 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5788  Methyltransferase type 12  44.44 
 
 
243 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.66 
 
 
227 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2023  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.37 
 
 
417 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 
541 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  33.33 
 
 
541 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  25.52 
 
 
252 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  26.53 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 
541 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0313  putative methyltransferase  50 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.459942  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7082  Methyltransferase type 11  30.09 
 
 
366 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517819  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  38.55 
 
 
249 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3940  Methyltransferase type 11  48 
 
 
262 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.524617  normal  0.24387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0148  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.17 
 
 
424 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  33.33 
 
 
541 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 
541 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  25 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>