More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7150 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7150  methyltransferase  100 
 
 		 249 aa  512  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04339  methyltransferase  44.35 
 
 		 261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3485  Methyltransferase type 11  38.43 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09370  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  38.36 
 
 		 256 aa  151  8.999999999999999e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.963324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3137  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2108  hypothetical protein  35.68 
 
 		 247 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1639  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 		 242 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.197359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4547  methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 254 aa  135  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577153  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4138  Methyltransferase type 11  33.88 
 
 		 254 aa  132  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07800  methyltransferase family protein  36.67 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33100  methyltransferase family protein  33.5 
 
 		 267 aa  95.1  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119457  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6712  methyltransferase type 12  31.34 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  32.31 
 
 		 575 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  27.89 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7688  methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 184 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  0.423955 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  32.65 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  31.94 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  31.94 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  31.94 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  31.94 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  26.74 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  31.94 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  31.94 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1427  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.527187  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  29.85 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  31.25 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  34.4 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.24 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  31.25 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2138  Methyltransferase type 11  37.39 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  30.25 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2057  Methyltransferase type 12  27.04 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  24.48 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  37.36 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  30.56 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  26.24 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1615  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  24.04 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl078  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  32.08 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0153588  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  25.87 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  26 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  27.23 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  35.17 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  24.32 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  25.24 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  27.17 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  28.15 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  28.08 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  24.32 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  28.08 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  41.79 
 
 		 429 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  27.4 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  27.4 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  27.4 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2097  hypothetical protein  36.67 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0205  hypothetical protein  32.71 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0716517  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  24.29 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  30.28 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  25 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2086  hypothetical protein  36.67 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  27.7 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  30.51 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 309 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  30.89 
 
 		 196 aa  53.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  29.85 
 
 		 304 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  32.14 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3090  hypothetical protein  33.03 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  26.17 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  29.38 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2593  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2978  hypothetical protein  33.01 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  28.57 
 
 		 268 aa  52.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0559  hypothetical protein  28.97 
 
 		 252 aa  52.4  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  23.87 
 
 		 226 aa  52.4  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  31.39 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 		 265 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  23.79 
 
 		 261 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  23.79 
 
 		 262 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  23.79 
 
 		 262 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 244 aa  52.4  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  32.38 
 
 		 249 aa  52  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  23.79 
 
 		 261 aa  52  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3271  Methyltransferase type 12  35.29 
 
 		 238 aa  52  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.128592 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  23.79 
 
 		 261 aa  52  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>