213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2057 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2057  Methyltransferase type 12  100 
 
 
254 aa  508  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  38.49 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  38.43 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  38.04 
 
 
253 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  39 
 
 
246 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.5 
 
 
250 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  34.39 
 
 
246 aa  132  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3818  methyltransferase type 12  36.19 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329874  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02460  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.63 
 
 
263 aa  128  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.712689  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4660  methyltransferase type 12  38.89 
 
 
250 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3703  methyltransferase type 12  38.89 
 
 
250 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.919771  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2128  methyltransferase type 11  37.11 
 
 
246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.26918 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  41.84 
 
 
249 aa  112  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2138  Methyltransferase type 11  41.71 
 
 
260 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.33 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.060018  normal  0.471088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  38.14 
 
 
242 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5594  Methyltransferase type 11  38.49 
 
 
249 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709179  normal  0.912769 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0586  Methyltransferase type 12  30.65 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  24.89 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  26.11 
 
 
239 aa  75.5  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  24.22 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  24.22 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  24.22 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  24.22 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  24.22 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  24.56 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  24.12 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21030  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.84 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  34.48 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7150  methyltransferase  27.04 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 
253 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  25.1 
 
 
258 aa  58.9  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  29.61 
 
 
270 aa  55.8  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  37.98 
 
 
329 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  23.66 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.21 
 
 
215 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  36.11 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  27.86 
 
 
296 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  28.02 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3714  hypothetical protein  37.84 
 
 
315 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000001291  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.37 
 
 
232 aa  53.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3444  hypothetical protein  37.84 
 
 
322 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000102357  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3407  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  37.84 
 
 
322 aa  53.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119678  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  39.2 
 
 
291 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3682  hypothetical protein  36.84 
 
 
315 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000635868  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  24.56 
 
 
220 aa  52.8  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1554  hypothetical protein  30.86 
 
 
315 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000923024  normal  0.0128521 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3156  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.75 
 
 
258 aa  52.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  32.88 
 
 
245 aa  52  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  32.05 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  25.46 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3762  hypothetical protein  26.04 
 
 
315 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000334692  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  26.55 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  32.05 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  26.55 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  35.53 
 
 
275 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3687  hypothetical protein  36.84 
 
 
315 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  27.52 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2432  methyltransferase type 11  34.19 
 
 
259 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  26.22 
 
 
249 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  25.17 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3341  methyltransferase type 11  35.09 
 
 
315 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506511  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf339  predicted O-methyltransferase  18.45 
 
 
242 aa  50.4  0.00003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00322712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2494  methyltransferase type 11  27.14 
 
 
254 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162443  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  31.93 
 
 
199 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  27.56 
 
 
262 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  25.78 
 
 
249 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3356  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  35.09 
 
 
318 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000127941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  26.22 
 
 
249 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 
276 aa  49.7  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4368  Methyltransferase type 12  35.34 
 
 
192 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  24.6 
 
 
251 aa  49.3  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  32 
 
 
192 aa  49.3  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  28.71 
 
 
235 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.48 
 
 
234 aa  49.7  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0911  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 
247 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  24.89 
 
 
249 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  34.15 
 
 
258 aa  48.9  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  33.94 
 
 
201 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  26.24 
 
 
575 aa  48.9  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.03 
 
 
220 aa  48.9  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  24.89 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  25.78 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  25.78 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  25.78 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33100  methyltransferase family protein  29.17 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119457  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  25.33 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.14 
 
 
254 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  25.19 
 
 
315 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  56.25 
 
 
197 aa  47.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4919  methyltransferase type 11  42.35 
 
 
285 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232669  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  34.91 
 
 
205 aa  47.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  25.33 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  27.21 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001478  SAM-dependent methyltransferase  31.73 
 
 
191 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.544466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  33.88 
 
 
285 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2987  Methyltransferase type 11  36.56 
 
 
290 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  25.19 
 
 
237 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.255053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>