283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4368 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4368  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 192 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  56.04 
 
 		 199 aa  192  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  54.59 
 
 		 201 aa  187  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3347  methyltransferase type 12  51.85 
 
 		 201 aa  176  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.84561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  51.91 
 
 		 423 aa  171  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  50.83 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2672  LigA  50 
 
 		 200 aa  154  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  49.19 
 
 		 207 aa  154  8e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  47.25 
 
 		 201 aa  148  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  47.25 
 
 		 201 aa  148  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  48.35 
 
 		 201 aa  148  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  47.25 
 
 		 201 aa  148  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  45.86 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  44.02 
 
 		 200 aa  138  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4890  methyltransferase type 12  44.26 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5057  Methyltransferase type 12  47.51 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14310  methyltransferase family protein  41.53 
 
 		 203 aa  128  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000424047  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3123  MCP methyltransferase, CheR-type  45.9 
 
 		 198 aa  127  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  47.02 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2432  methyltransferase type 11  40.89 
 
 		 259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  38.95 
 
 		 195 aa  92  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  31.3 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  32.52 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2057  Methyltransferase type 12  35.34 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  37.39 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3557  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  32.37 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  37.17 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  31.11 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  27.04 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  27.12 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.85 
 
 		 260 aa  53.9  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.33 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  34.97 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 259 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 304 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  27.91 
 
 		 575 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  42.17 
 
 		 259 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.9 
 
 		 250 aa  52.4  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  45.1 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 249 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  34.46 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.33 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 228 aa  52  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  34.62 
 
 		 200 aa  51.6  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  39.32 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0907  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 220 aa  51.6  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 254 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 319 aa  51.2  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  31.09 
 
 		 206 aa  51.2  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  28.17 
 
 		 263 aa  51.2  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  42 
 
 		 291 aa  51.2  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 265 aa  50.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  25.36 
 
 		 390 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  40.79 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 240 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  32.61 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  25.16 
 
 		 263 aa  50.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3350  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 267 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.18 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2718  Methyltransferase type 12  33.88 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  35.17 
 
 		 257 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0137  methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 248 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 262 aa  49.7  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  26.35 
 
 		 247 aa  49.7  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  28.88 
 
 		 247 aa  49.7  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 		 268 aa  48.9  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  35.95 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  34.21 
 
 		 254 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  30 
 
 		 258 aa  48.5  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3478  hypothetical protein  26.85 
 
 		 257 aa  48.9  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0815915 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  36.05 
 
 		 244 aa  48.5  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 429 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 305 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 226 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 225 aa  48.5  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 280 aa  48.5  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 257 aa  48.5  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  31.86 
 
 		 237 aa  48.1  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  47.06 
 
 		 258 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.67 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.68 
 
 		 155 aa  48.1  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  31.71 
 
 		 262 aa  47.8  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  28.71 
 
 		 250 aa  47.8  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  25.34 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 252 aa  48.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 252 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4416  Methyltransferase type 11  41.59 
 
 		 264 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 251 aa  47.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1814  methyltransferase type 12  22.76 
 
 		 263 aa  47  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  32.2 
 
 		 251 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>