More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5057 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_5057  Methyltransferase type 12  100 
 
 
201 aa  390  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  72.64 
 
 
201 aa  289  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  72.64 
 
 
201 aa  289  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  72.64 
 
 
201 aa  289  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  73.13 
 
 
201 aa  287  9e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4890  methyltransferase type 12  70.85 
 
 
201 aa  270  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  67.16 
 
 
201 aa  263  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  63.64 
 
 
207 aa  245  4e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  57.21 
 
 
201 aa  223  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  58.42 
 
 
423 aa  216  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  57.29 
 
 
199 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  58.29 
 
 
201 aa  214  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3347  methyltransferase type 12  57.79 
 
 
201 aa  211  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.84561  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3123  MCP methyltransferase, CheR-type  58.46 
 
 
198 aa  202  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  51.02 
 
 
200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2672  LigA  54.5 
 
 
200 aa  176  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  54.08 
 
 
205 aa  174  5e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14310  methyltransferase family protein  48.21 
 
 
203 aa  165  4e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000424047  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4368  Methyltransferase type 12  46.96 
 
 
192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2432  methyltransferase type 11  37.95 
 
 
259 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  37.44 
 
 
195 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  42.74 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  36.22 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  33.09 
 
 
217 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  36.07 
 
 
219 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  33.33 
 
 
246 aa  59.7  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
252 aa  59.7  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  25.55 
 
 
264 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  31 
 
 
237 aa  58.9  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  34.48 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
210 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  35.14 
 
 
246 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 
240 aa  55.8  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 
254 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2249  methyltransferase type 12  28.68 
 
 
217 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.200806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  30.88 
 
 
218 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
243 aa  54.7  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
208 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 
252 aa  53.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  35.51 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  27.61 
 
 
292 aa  53.5  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  35.45 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  27.36 
 
 
250 aa  53.1  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  30.17 
 
 
253 aa  52.8  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  36.62 
 
 
267 aa  53.1  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  31.11 
 
 
263 aa  53.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  28.33 
 
 
390 aa  52.8  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
225 aa  52.4  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1201  glycosyltransferase  35.85 
 
 
476 aa  52  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0256337  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
228 aa  51.6  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  34.62 
 
 
238 aa  51.2  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  43.4 
 
 
251 aa  51.2  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1558  tellurite resistance protein TehB  26.92 
 
 
291 aa  50.8  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  35.82 
 
 
242 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  36.99 
 
 
246 aa  50.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  27.62 
 
 
247 aa  50.8  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.97 
 
 
236 aa  50.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
215 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  26.92 
 
 
541 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  32.81 
 
 
304 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  24.22 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  31.06 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  26.92 
 
 
541 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  30.12 
 
 
220 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  30.07 
 
 
242 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  24.38 
 
 
236 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  43.75 
 
 
319 aa  49.7  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  24.38 
 
 
236 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  30 
 
 
259 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  25.13 
 
 
541 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  32.24 
 
 
200 aa  49.3  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  28.1 
 
 
212 aa  49.3  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  37.14 
 
 
211 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
262 aa  49.3  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  24.52 
 
 
541 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 
301 aa  48.9  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  38.94 
 
 
232 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 
251 aa  48.9  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1814  methyltransferase type 12  29.41 
 
 
263 aa  48.9  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  25.98 
 
 
201 aa  48.5  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  24.38 
 
 
199 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
265 aa  48.5  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33100  methyltransferase family protein  32.89 
 
 
267 aa  48.5  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119457  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  29.91 
 
 
208 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
241 aa  48.5  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  25.23 
 
 
220 aa  48.5  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
232 aa  48.5  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  28.07 
 
 
249 aa  48.5  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  35.51 
 
 
196 aa  48.1  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 
996 aa  48.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  23.75 
 
 
236 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  23.08 
 
 
215 aa  48.1  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  28.32 
 
 
226 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  27.43 
 
 
236 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2699  methyltransferase type 12  38.6 
 
 
231 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  31.25 
 
 
190 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  41.88 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  37.27 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>