256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3478 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3478  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  533  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0815915 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1814  methyltransferase type 12  44.13 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  25.57 
 
 		 315 aa  65.1  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  24.08 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  24.07 
 
 		 251 aa  62  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  25 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  24.38 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  23.48 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  23.48 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  23.48 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  21.67 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  24.38 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  23.48 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  23.48 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  36.36 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  23.61 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  23.27 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  23.04 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  25.67 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1911  Methyltransferase type 11  25.23 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  34.51 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  21.76 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1615  methyltransferase type 11  24.22 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  38.16 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  22.08 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  37.18 
 
 		 195 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  32 
 
 		 637 aa  52.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 274 aa  52.4  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  27.27 
 
 		 663 aa  52.4  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2749  Methyltransferase type 11  27.04 
 
 		 252 aa  52.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 280 aa  52  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  24.47 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  23.17 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  25.53 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  35.8 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  20.42 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3002  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.19 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  42.86 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0677  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  25.85 
 
 		 575 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  26.23 
 
 		 274 aa  49.7  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  34.44 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  27.68 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  31.4 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  37.33 
 
 		 246 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  22.76 
 
 		 205 aa  49.7  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  25.11 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  26.39 
 
 		 423 aa  49.3  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  31.58 
 
 		 273 aa  49.3  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 234 aa  49.3  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  23.29 
 
 		 207 aa  48.9  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 247 aa  48.9  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1085 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  32.26 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.37 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3347  methyltransferase type 12  24.11 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.84561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1803  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0795517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  27.63 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1872  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466783  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.36 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3050  methyltransferase type 11  34.88 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  25.42 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0529  RNA methyltransferase, TrmA family protein  32.35 
 
 		 444 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  28.04 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02630  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  30.69 
 
 		 433 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00985329  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4368  Methyltransferase type 12  24.07 
 
 		 192 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  34.94 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2432  methyltransferase type 11  34 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.11 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  28.99 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33100  methyltransferase family protein  33.33 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119457  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  32.98 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02592  hypothetical protein  30.69 
 
 		 433 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00971306  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  23.81 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2766  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.14 
 
 		 450 aa  47  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000280871  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1224  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.14 
 
 		 450 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00249304  hitchhiker  0.000020369 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.94 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  32.91 
 
 		 220 aa  46.6  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3290  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.14 
 
 		 450 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0140033  hitchhiker  0.000775175 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  32.97 
 
 		 234 aa  46.6  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  34.52 
 
 		 289 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3145  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.14 
 
 		 450 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000412374  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1354  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.82 
 
 		 445 aa  46.6  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.961347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0108  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.44 
 
 		 249 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36.49 
 
 		 449 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08556  methyltransferase, putative  26.84 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>