More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0393 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  100 
 
 		 246 aa  510  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  39.66 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  37.97 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  37.55 
 
 		 253 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2128  methyltransferase type 11  36.44 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.26918 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.03 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3818  methyltransferase type 12  38.05 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2057  Methyltransferase type 12  34.39 
 
 		 254 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4660  methyltransferase type 12  37.07 
 
 		 250 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3703  methyltransferase type 12  37.07 
 
 		 250 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.919771  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  36.73 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2138  Methyltransferase type 11  35.17 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  33.77 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.08 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.060018  normal  0.471088 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02460  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.54 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.712689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5594  Methyltransferase type 11  37.23 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709179  normal  0.912769 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21030  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.51 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  30.14 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  27.91 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33100  methyltransferase family protein  27.54 
 
 		 267 aa  88.6  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119457  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0586  Methyltransferase type 12  28.02 
 
 		 239 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  28.79 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  28.64 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  26.87 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  27.7 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  26.73 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  26.76 
 
 		 261 aa  72  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  26.76 
 
 		 261 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  27.6 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  27.6 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  38.1 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  35.65 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  29.58 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  39.33 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.59 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 276 aa  67  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  37.4 
 
 		 205 aa  67  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  27.01 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  35.92 
 
 		 663 aa  64.7  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  38.33 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  40.35 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  41.67 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  30.66 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  39.05 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  27.01 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  39.45 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.85 
 
 		 241 aa  62  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 257 aa  62  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 267 aa  62  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  33.05 
 
 		 315 aa  62  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 260 aa  62  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  32.33 
 
 		 212 aa  62  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  38.39 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  39.58 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.85 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2432  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  25.93 
 
 		 575 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  39.58 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.58 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1911  Methyltransferase type 11  28.19 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  30.43 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.62 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  32.72 
 
 		 637 aa  59.3  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  30.43 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  24.4 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  38.1 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  24.2 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  35.94 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  30.43 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  30.43 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0178  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  30.43 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  30.43 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  33.55 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  33.33 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7150  methyltransferase  30.56 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  22.9 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0872  hypothetical protein  32.33 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.0675112 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  36.7 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.920787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>