More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1264 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 262 aa  543  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  61.07 
 
 		 262 aa  323  1e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  53.23 
 
 		 280 aa  289  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  56.32 
 
 		 262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  57.32 
 
 		 261 aa  285  5.999999999999999e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  52.03 
 
 		 262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  51.21 
 
 		 259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  32.53 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2494  methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 254 aa  131  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162443  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  30.59 
 
 		 251 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08556  methyltransferase, putative  31.43 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 637 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  30.89 
 
 		 253 aa  108  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  34.38 
 
 		 663 aa  105  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  33.49 
 
 		 250 aa  105  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 252 aa  98.6  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  27.56 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 675 aa  93.2  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  32.42 
 
 		 252 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  29.74 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  32.29 
 
 		 638 aa  82  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  39.22 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  27.18 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0137  methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  29.56 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  28.31 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  29.56 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  34.95 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  28.91 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3970  methyltransferase type 11  27.75 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  normal  0.529582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4859  hypothetical protein  37.5 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.069885 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2206  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000097592  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  28.34 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  34.31 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  27.54 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3818  methyltransferase type 12  26.92 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115347 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  37.36 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  30.17 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0677  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  27.85 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  35.92 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4660  methyltransferase type 12  25.48 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3703  methyltransferase type 12  25.48 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.919771  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  23.85 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2460  hypothetical protein  25.76 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.171848  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04339  methyltransferase  28.36 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  26.24 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.7 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.29 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  28 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3113  Methyltransferase type 11  23.83 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  25.39 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  27.91 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  39.8 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  26.34 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  38.54 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  25.39 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  25.39 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  25.39 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  25.39 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  25.39 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  24.87 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  38.54 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4732  Methyltransferase type 11  27.51 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  38.54 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  24.87 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  28.18 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  24.87 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.5 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  39.8 
 
 		 288 aa  57  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0179  Methyltransferase type 12  36.79 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  31.03 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  36.28 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  21.7 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  31.3 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  30.39 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>