More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3563 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  100 
 
 
249 aa  515  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  37.65 
 
 
255 aa  195  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  38.68 
 
 
304 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3114  Methyltransferase type 12  36.03 
 
 
247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  37.7 
 
 
252 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
250 aa  113  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 
675 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  29.44 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  33.82 
 
 
663 aa  105  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  32.57 
 
 
256 aa  102  5e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  30.9 
 
 
637 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  27.85 
 
 
250 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  30.69 
 
 
253 aa  99.4  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  28.05 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  24.3 
 
 
264 aa  97.1  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
246 aa  95.9  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  28.08 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  29.92 
 
 
251 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
271 aa  93.2  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  30.13 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  29.18 
 
 
255 aa  90.1  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0098  methyltransferase type 11  27.48 
 
 
262 aa  88.6  8e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.972554  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  26.88 
 
 
262 aa  86.3  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1128  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
257 aa  85.9  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  29.76 
 
 
261 aa  85.9  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1346  methyltransferase type 11  26.8 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0961707 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0379  methyltransferase type 11  26.8 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.292052  normal  0.0841223 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  24.78 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  31.53 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1748  methyltransferase type 11  26.4 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.620852  normal  0.453754 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  28.26 
 
 
247 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  28.85 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  27.8 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  24.69 
 
 
243 aa  75.1  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  25.51 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  30.48 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  29.56 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  27.13 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  26.8 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  41.82 
 
 
638 aa  72  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08556  methyltransferase, putative  30.19 
 
 
243 aa  72  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  25.32 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  28.63 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  25.25 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  26.99 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  24.89 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  24.89 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  24.89 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  24.89 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  24.89 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  24.89 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  26.55 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  26.9 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  28.02 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  23.74 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2494  methyltransferase type 11  25.97 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162443  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  27.7 
 
 
286 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1181  methyltransferase type 12  27.56 
 
 
268 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  25.51 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  24.46 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  24.14 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  24.26 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  24.46 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  23.89 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  27.35 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3113  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
273 aa  65.1  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  26.43 
 
 
239 aa  64.3  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1869  hypothetical protein  28.44 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0179  Methyltransferase type 12  26.36 
 
 
272 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2158  hypothetical protein  27.56 
 
 
245 aa  63.2  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  32.11 
 
 
296 aa  63.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0677  Methyltransferase type 11  25.78 
 
 
233 aa  62.8  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  26.85 
 
 
246 aa  62.8  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  28.91 
 
 
262 aa  62.8  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6748  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 
267 aa  62.4  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  23.15 
 
 
244 aa  62.4  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  26.03 
 
 
276 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  27.97 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3557  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 
280 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  22.69 
 
 
269 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0998  Methyltransferase type 11  26.59 
 
 
247 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  25.84 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  24.35 
 
 
541 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  24.11 
 
 
249 aa  60.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  25.45 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2856  methyltransferase type 12  24.51 
 
 
269 aa  60.1  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  29.31 
 
 
208 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2460  hypothetical protein  25.7 
 
 
281 aa  59.3  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.171848  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  29.77 
 
 
220 aa  59.3  0.00000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1678  methyltransferase type 12  26.84 
 
 
268 aa  59.3  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0186038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  23.85 
 
 
262 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  24.35 
 
 
541 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  23.85 
 
 
262 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  32.35 
 
 
267 aa  58.9  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  26.36 
 
 
251 aa  58.9  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>