More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2499 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  517  1e-146  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  35.48 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  36.59 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  33.17 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  32.73 
 
 
637 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 
261 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  26.69 
 
 
262 aa  103  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
262 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  28.08 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  27.67 
 
 
280 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 
262 aa  93.6  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  24.62 
 
 
259 aa  94  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  32.8 
 
 
663 aa  93.6  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  25.7 
 
 
246 aa  92.8  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  30.12 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  30.2 
 
 
675 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  29.23 
 
 
251 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  25.1 
 
 
262 aa  85.9  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  29.67 
 
 
304 aa  85.5  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  24.71 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  25.91 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  25.78 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  30.96 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2460  hypothetical protein  26.72 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.171848  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 
244 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  24.3 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0098  methyltransferase type 11  26.42 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.972554  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  26.42 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  25.99 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  27.23 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  27.4 
 
 
240 aa  72  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2494  methyltransferase type 11  22.8 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162443  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  24.8 
 
 
245 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  25.57 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  21.66 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  25.1 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  23.83 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  26.36 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3970  methyltransferase type 11  27.31 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  normal  0.529582 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1615  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 
249 aa  68.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  24.7 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1748  methyltransferase type 11  25.99 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.620852  normal  0.453754 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1366  hypothetical protein  26.5 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.229777  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2188  methyltransferase type 11  25.56 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  27.67 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  26.76 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  26.29 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  23.5 
 
 
249 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  23.33 
 
 
249 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  23.5 
 
 
249 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  23.5 
 
 
249 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  23.5 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  23.39 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  23.5 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  28.97 
 
 
244 aa  63.5  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  23.39 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  23.43 
 
 
232 aa  63.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08556  methyltransferase, putative  21.29 
 
 
243 aa  63.2  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  25.12 
 
 
277 aa  63.2  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1346  methyltransferase type 11  23.71 
 
 
258 aa  63.2  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0961707 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  23.68 
 
 
244 aa  62.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  23.04 
 
 
249 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  23.04 
 
 
249 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  23.56 
 
 
238 aa  62.4  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  23.56 
 
 
238 aa  62.4  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1058  methyltransferase type 12  28.99 
 
 
254 aa  62  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  26.56 
 
 
259 aa  62  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 
252 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  23.5 
 
 
249 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  27.67 
 
 
638 aa  61.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  23.47 
 
 
233 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0137  methyltransferase type 11  24.79 
 
 
248 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2863  hypothetical protein  26.85 
 
 
254 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276445 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  24.41 
 
 
254 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2585  methyltransferase  26.85 
 
 
254 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0379  methyltransferase type 11  25 
 
 
257 aa  60.1  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.292052  normal  0.0841223 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  23.89 
 
 
251 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2664  hypothetical protein  26.85 
 
 
254 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2616  methyltransferase  26.85 
 
 
254 aa  59.3  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183675  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  24.49 
 
 
280 aa  59.3  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3113  Methyltransferase type 11  27.72 
 
 
273 aa  59.3  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2858  hypothetical protein  26.85 
 
 
254 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  24.88 
 
 
247 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  24.77 
 
 
262 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3114  Methyltransferase type 12  24.15 
 
 
247 aa  58.9  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  24.77 
 
 
262 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  24.76 
 
 
276 aa  58.9  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  20.18 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  32.35 
 
 
243 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  24.55 
 
 
575 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  26.11 
 
 
275 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  32.08 
 
 
541 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  32.08 
 
 
541 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0618  methyltransferase type 12  26.03 
 
 
280 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00582618  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1051  Methyltransferase type 12  24.88 
 
 
264 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235012  normal  0.0241344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>