270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0137 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0137  methyltransferase type 11  100 
 
 		 248 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  31.46 
 
 		 253 aa  92  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2494  methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162443  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  28.04 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  35.25 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  26.91 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08556  methyltransferase, putative  35.82 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  26.76 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  29.92 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  29.8 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  26.05 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  26.92 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  28.28 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  26.46 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  27.64 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  39 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  31.08 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  24.79 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14310  methyltransferase family protein  39.81 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000424047  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  24.19 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  37.1 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  24.3 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 319 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  33.33 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0179  Methyltransferase type 12  30.73 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  42.11 
 
 		 423 aa  55.8  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  43.75 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  26.91 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  43.4 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  39.76 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  31.5 
 
 		 663 aa  53.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  33.08 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  28.85 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  38.3 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  43.84 
 
 		 222 aa  52.8  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  28.36 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 254 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  29.85 
 
 		 541 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1748  methyltransferase type 11  25.51 
 
 		 257 aa  52.4  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.620852  normal  0.453754 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  26.64 
 
 		 249 aa  52  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  22.07 
 
 		 237 aa  52  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  41.77 
 
 		 311 aa  52  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1058  methyltransferase type 12  25.88 
 
 		 254 aa  52  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  27.15 
 
 		 675 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1346  methyltransferase type 11  23.85 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0961707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4859  hypothetical protein  27.5 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.069885 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  35.56 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  27.6 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0379  methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.292052  normal  0.0841223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2188  methyltransferase type 11  25.96 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  27.44 
 
 		 575 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  29.1 
 
 		 541 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  29.1 
 
 		 541 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  38.24 
 
 		 400 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  36.05 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  36.56 
 
 		 272 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  29.1 
 
 		 541 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  48 
 
 		 311 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  29.1 
 
 		 541 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 269 aa  49.7  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  40 
 
 		 310 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  50.75 
 
 		 224 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4890  methyltransferase type 12  37.04 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  33 
 
 		 207 aa  49.3  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  36.26 
 
 		 190 aa  49.3  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 201 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 201 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  35 
 
 		 200 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 201 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  25.57 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  24.08 
 
 		 296 aa  48.9  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  24.08 
 
 		 255 aa  48.9  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 268 aa  48.9  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  27.75 
 
 		 209 aa  48.9  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  40.91 
 
 		 212 aa  48.5  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  24.15 
 
 		 637 aa  48.5  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  23.6 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3235  methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3970  methyltransferase type 11  27.14 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  normal  0.529582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>